工厂加班费在计算经济补偿金时，是可以计入工资总额的，因此加班费也会间接影响经济补偿金的计算。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，经济补偿金是按照劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付的。这里的“月工资”是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。而根据《关于工资总额组成的规定》，工资总额由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资等六个部分组成。因此，加班费作为工资总额的一部分，在计算经济补偿金时应当被纳入考虑。
加班费如何影响经济补偿金
加班费计入月工资：在计算经济补偿金时，加班费会作为月工资的一部分被计入。这意味着，如果劳动者在劳动合同解除或终止前有加班的情况，并且获得了相应的加班费，那么这部分加班费将会提高其月工资的平均水平，从而可能增加经济补偿金的数额。
具体计算方式：经济补偿金的计算公式为：经济补偿金=工作年限×月工资。其中，月工资是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，包括加班费在内的所有工资性收入。因此，加班费越多，月工资的平均水平就越高，经济补偿金的数额也就可能越大。
特殊情况与注意事项
加班费的合法性：虽然加班费可以计入经济补偿金，但前提是加班费必须是合法支付的。如果工厂未按照法律规定支付加班费，劳动者有权要求工厂补发，并且在计算经济补偿金时，这部分未支付的加班费也应当被计入。
经济补偿金的封顶：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿金的标准将按照职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿金的年限最高不超过十二年。在这种情况下，加班费虽然仍然会计入月工资，但可能不会对经济补偿金的最终数额产生太大影响。
实际操作建议
保留加班证据：劳动者在加班时应当保留好相关的证据，如加班通知、考勤记录、加班审批单等，以便在需要时证明自己的加班情况。
核对工资条：劳动者应当定期核对自己的工资条，确保加班费等工资性收入被正确计算和支付。如果发现工资条上有误或未支付加班费的情况，应当及时与工厂沟通并要求补发。
咨询专业律师：如果劳动者在计算经济补偿金或处理加班费问题时遇到困难或疑问，可以直接向我咨询。我会根据具体情况为你提供专业的法律建议和帮助。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。