核心结论：针对您描述的情况，修理厂无权扣留您的车辆，更无权将车辆用于非法活动。您可以通过协商、投诉或法律途径解决此事，并追究修理厂的相关责任。以下是具体分析：

1. 修理厂无权扣留车辆
   根据《民法典》第四百四十七条，留置权的行使需满足三个条件：

   • 债权已到期；
     
   • 债权人合法占有债务人的动产；
     
   • 债权的发生与该动产属于同一法律关系（如修车合同）。
     但即使修理厂享有留置权，其扣留车辆的目的仅限于“督促支付费用”，而非将车辆用于其他用途。若修理厂擅自使用车辆（尤其是非法活动），已超出留置权的合理范围，构成侵权。

2. 修理厂将车辆用于非法活动的责任

   • 刑事责任：若修理厂利用您的车辆实施犯罪（如盗窃、运输违禁品等），您作为车主可能面临车辆被查扣、协助调查等程序，但一般不直接承担刑事责任（除非您明知或共谋）。
     
   • 民事责任：您可要求修理厂赔偿因车辆被非法使用导致的损失（如车辆贬值、维修费用、交通罚款等），并主张精神损害赔偿（若造成严重后果）。
     
   • 行政责任：修理厂的行为可能违反《治安管理处罚法》或《道路交通安全法》，您可向公安机关举报，要求对其行政处罚。

3. 您的应对措施

   • 立即报警：固定修理厂非法使用车辆的证据（如监控录像、证人证言），要求公安机关立案调查，并追回车辆。
     
   • 协商解决：与修理厂沟通，要求其停止侵权行为、返还车辆并赔偿损失。若对方拒绝，可录音录像作为证据。
     
   • 法律诉讼：向法院提起侵权之诉，主张修理厂返还车辆、赔偿损失，并申请诉前财产保全（防止车辆被转移或毁损）。
     
   • 投诉举报：向当地市场监督管理部门或交通运输管理部门投诉修理厂的违法行为，推动行政处罚。

4. 风险提示

   • 若车辆被用于犯罪，您需配合调查并证明自身无过错（如提供修车合同、付款记录等），避免被牵连。
     
   • 及时检查车辆状况，若发现损坏或违章记录，立即固定证据并要求修理厂承担责任。
     

建议：优先通过报警和协商快速解决问题，若修理厂态度恶劣或损失较大，可委托律师介入诉讼。如有进一步证据或细节需要分析，可直接向我咨询。