用人单位签订合作协议本身是合法的，但具体是否正规需视协议内容、签订程序及双方资质等因素而定。以下从多个角度为你详细分析：

一、合作协议的合法性基础

1. 合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人依法享有自愿订立合同的权利。用人单位作为民事主体，有权与其他单位或个人签订合作协议，以明确双方的权利和义务。这是合作协议合法性的基础。

2. 合法目的与形式：合作协议的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。同时，协议的形式应当符合法律要求，如采用书面形式等，以确保协议的有效性和可执行性。

二、判断合作协议是否正规的关键因素

1. 协议内容是否明确：

   • 合作协议中应详细约定双方的权利和义务，包括合作方式、期限、费用分担、保密条款等。
   • 协议内容应具体、明确，避免模糊不清或产生歧义，以确保双方对合作有共同的理解。

2. 签订程序是否合规：

   • 签订合作协议应遵循法定的程序和要求，如经过必要的审批、备案等手续（如果法律法规有要求的话）。
   • 双方应在平等、自愿的基础上签订协议，确保协议的签订是双方真实意思的表示。

3. 双方资质是否合格：

   • 用人单位应对合作方的资质、信誉等进行全面审查，确保合作方具备履行合同的能力。
   • 如果合作方为法人或其他组织，应查验其营业执照、法定代表人身份证明等文件；如果合作方为个人，应核实其身份信息及履约能力。

三、合作协议可能存在的风险及防范

1. 风险：

   • 协议内容不明确可能导致双方对合作的理解产生分歧，进而引发纠纷。
   • 签订程序不合规可能影响协议的法律效力，甚至导致协议无效。
   • 合作方资质不合格可能导致协议无法履行或履行过程中出现问题。

2. 防范：

   • 在签订合作协议前，双方应充分沟通并明确合作的具体内容、目标以及预期成果。
   • 遵循法定程序和要求签订协议，确保协议的法律效力。
   • 对合作方的资质、信誉等进行全面审查，降低合作风险。

四、实际案例与法律建议

• 实际案例：假设某用人单位与一家不具备相应资质的公司签订了合作协议，结果在合作过程中发现对方无法履行合同义务，导致用人单位遭受损失。这种情况下，由于合作方资质不合格，协议可能无法得到有效履行，用人单位也难以通过法律途径维护自己的权益。

• 法律建议：在签订合作协议前，用人单位应务必对合作方的资质、信誉等进行全面审查，并确保协议内容明确、签订程序合规。如果可能的话，可以寻求专业律师的帮助，对协议进行法律审查，以确保协议的合法性和有效性。

总结来说，用人单位签订合作协议本身是合法的，但具体是否正规需视协议内容、签订程序及双方资质等因素而定。为了确保合作协议的合法性和有效性，用人单位在签订协议前应进行充分的审查和准备。如果你在签订合作协议过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。