结论：公安机关在以行政案件立案后，若发现应当立为刑事案件，确实需要重新制作刑事案件立案决定书。
分析说明：
行政案件与刑事案件的区别：
- 行政案件主要涉及违反行政管理法规的行为，由公安机关等行政机关进行调查和处理，其目的在于维护行政管理秩序。
- 刑事案件则涉及违反刑法的行为，由公安机关、人民检察院和人民法院等司法机关进行侦查、起诉和审判，其目的在于惩罚犯罪和保护人民。
立案决定书的性质：
- 立案决定书是公安机关对案件进行立案时制作的法律文书，它标志着案件正式进入侦查或处理程序。
- 行政案件立案决定书与刑事案件立案决定书在性质、目的和程序上均有所不同。
案件性质转变时的处理：
- 当公安机关在调查行政案件过程中，发现案件性质可能涉及刑事犯罪时，应当及时将案件性质转变为刑事案件。
- 由于行政案件与刑事案件在立案程序、侦查措施、证据收集等方面存在显著差异，因此，在案件性质转变后，公安机关需要重新制作刑事案件立案决定书，以符合刑事诉讼法的规定。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关在侦查过程中发现案件应当立为刑事案件的，应当依法立案侦查，并制作相应的立案决定书。
- 虽然具体条款可能未直接提及“行政案件转刑事案件需重新制作立案决定书”，但根据刑事诉讼法的立法精神和原则，以及司法实践中的通常做法，可以推断出这一结论。
法律建议：
- 对于公安机关而言，在调查行政案件过程中，应保持高度警惕，及时发现可能涉及刑事犯罪的线索和证据。
- 一旦发现案件性质可能涉及刑事犯罪，应立即按照刑事诉讼法的规定进行立案侦查，并制作刑事案件立案决定书。
- 在案件处理过程中，应严格遵守刑事诉讼法的相关规定，确保案件处理的合法性和公正性。
后续行动：
- 若您或您身边的人遇到类似情况，即公安机关在调查行政案件过程中发现应当立为刑事案件，但未重新制作刑事案件立案决定书，您可以向公安机关提出质疑，并要求其依法处理。
- 若公安机关未予理会或处理不当，您可以向上一级公安机关或人民检察院进行申诉或控告，以维护自己的合法权益。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。