结论前置：对于未经批准占用集体建设用地的违法行为，可以适用《城乡规划法》进行处罚，但具体处罚措施需结合违法行为的性质、情节以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、法律适用性分析

1. 《城乡规划法》的适用范围
   根据《城乡规划法》第二条，该法适用于城市、镇规划区内的建设活动，包括土地利用和空间布局。若集体建设用地位于城乡规划区内，且未经批准擅自占用或建设，则直接违反《城乡规划法》第四十条（未取得建设工程规划许可证进行建设）或第四十四条（未取得乡村建设规划许可证进行建设），可依法处罚。

2. 与《土地管理法》的衔接
   若占用行为同时违反《土地管理法》第七十七条（未经批准非法占用土地），则可能面临双重处罚：

   • 土地管理部门：责令退还土地、限期拆除或没收违法建筑、罚款；
     
   • 城乡规划部门：若涉及规划区内建设，可依据《城乡规划法》第六十四条或第六十五条进一步处罚（如责令停止建设、限期改正、罚款等）。

二、具体处罚措施

1. 责令停止建设与限期改正

   • 若违法行为尚可采取改正措施消除对规划的影响（如未按规划许可建设但符合总体规划），规划部门可责令限期改正，并处建设工程造价5%-10%的罚款。

2. 限期拆除或没收

   • 若无法采取改正措施（如占用永久基本农田、破坏生态等），规划部门可责令限期拆除；逾期不拆的，可申请法院强制执行，拆除费用由违法者承担。
     
   • 若违法建筑位于乡村规划区内且无法改正，乡镇政府可责令限期拆除。

3. 罚款标准

   • 根据《城乡规划法》第六十四条，罚款金额为建设工程造价的5%-10%；若无法确定造价，可参照同类工程市场价格计算。
     
   • 例如：违法建设一栋造价100万元的厂房，罚款范围为5万-10万元。

4. 刑事责任风险

   • 若占用行为导致耕地大量毁坏（如非法占用农用地5亩以上），可能构成《刑法》第三百四十二条规定的“非法占用农用地罪”，处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金。

三、特殊情形处理

1. 历史遗留问题

   • 若占用行为发生在《城乡规划法》实施前（2008年1月1日前），且符合当时政策或已形成长期稳定使用状态，可能适用“法不溯及既往”原则，通过补办手续合法化，而非直接处罚。

2. 临时用地

   • 若占用集体建设用地为临时性质（如施工堆料、地质勘查），需依法办理临时用地审批手续。未办理的，仍属违法，但处罚可能较轻（如责令限期恢复原状、罚款）。

四、实务建议

1. 自查合规性

   • 占用集体建设用地前，务必确认是否已取得《乡村建设规划许可证》或《建设工程规划许可证》，并核对用地范围、用途是否与规划一致。

2. 主动整改

   • 若已违法，建议立即停止建设，向规划部门申请补办手续或自行拆除，以减轻处罚后果。

3. 争议解决

   • 若对处罚决定不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，但需注意时效（复议60日内、诉讼6个月内）。

总结：未经批准占用集体建设用地可能同时违反《城乡规划法》和《土地管理法》，处罚措施包括责令停止建设、限期拆除、罚款甚至刑事责任。具体适用需结合用地位置、规划要求及违法情节综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案例的处理方案。