兽医站不给开检疫证明是否合法，需分情况讨论：
若兽医站具备开具检疫证明的资质且动物符合检疫条件：
- 不合法。根据《中华人民共和国动物防疫法》的相关规定，动物卫生监督机构（通常包括兽医站等具备相应资质的机构）在接到检疫申报后，应当及时指派官方兽医对动物、动物产品实施检疫。对检疫合格的，应当出具检疫证明、加施检疫标志。因此，如果兽医站具备开具检疫证明的资质，且动物符合检疫条件，那么兽医站拒绝开具检疫证明的行为是不合法的。
若兽医站不具备开具检疫证明的资质：
- 合法但需指引。如果兽医站本身不具备开具检疫证明的资质，那么它拒绝开具检疫证明的行为是合法的，因为它没有权力进行这一操作。但兽医站应当告知申报人前往具备资质的机构进行检疫申报，以确保动物的合法流通和公共卫生安全。
若动物不符合检疫条件：
- 合法但需说明理由。如果动物不符合检疫条件，如存在疫情、疾病或其他不符合检疫标准的情况，兽医站有权拒绝开具检疫证明。但兽医站应当向申报人说明拒绝的理由，并告知其如何改进或处理动物以达到检疫标准。
法律建议：
- 如果您认为兽医站的行为不合法，且您具备合法的检疫申报资格和动物符合检疫条件，您可以向当地的动物卫生监督机构或农业行政主管部门投诉，要求其调查并处理兽医站的违法行为。
- 在进行检疫申报时，请确保您提供的动物信息真实、准确，并符合检疫标准，以避免因信息不实或动物不符合标准而导致的检疫证明开具失败。
可能后果：
- 如果兽医站非法拒绝开具检疫证明，且您因此遭受了损失（如动物无法及时运输、销售等），您有权要求兽医站承担相应的赔偿责任。
- 如果您故意提供虚假信息或隐瞒动物不符合检疫标准的情况，以骗取检疫证明，您将可能面临法律责任，包括罚款、没收违法所得等。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。