若串标案件中检察机关作出不予起诉决定，后续处理需结合具体情形分步骤推进，以下是详细分析：

1. 审查不予起诉决定的类型及法律后果
   根据《刑事诉讼法》第177条，不予起诉分为两种：

   • 法定不起诉（如情节显著轻微、已过追诉时效等）：此时刑事程序彻底终结，行为人不构成犯罪，无需承担刑事责任。
     
   • 酌定不起诉（如犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚）：虽不追究刑事责任，但可能面临行政处罚或行业惩戒。
     
   • 存疑不起诉（证据不足）：若后续发现新证据，检察机关可重新起诉，需保持警惕。

2. 行政责任与行业惩戒的衔接
   即使刑事程序终结，串标行为仍可能违反《招标投标法》第53条，面临：

   • 行政处罚：由行政监督部门（如发改委、住建部门）处项目金额5‰以上10‰以下罚款，对单位直接负责的主管人员和其他责任人员处单位罚款数额5%以上10%以下罚款；
     
   • 行业禁入：可能被列入“黑名单”，限制参与招投标活动（期限通常为1-3年，具体依地方规定）；
     
   • 资质处罚：若涉及施工企业，可能被降低资质等级或吊销资质证书。

3. 民事赔偿与信用修复

   • 民事赔偿：若串标行为导致其他投标人损失（如差旅费、投标文件制作费等），可能被要求民事赔偿；
     
   • 信用修复：主动向行政监督部门提交整改报告，参加合规培训，可申请提前移出“黑名单”，恢复市场参与资格。

4. 后续法律风险防范

   • 证据保留：妥善保存检察机关《不起诉决定书》及送达回证，作为后续抗辩依据；
     
   • 合规审查：对企业的招投标流程进行全面合规审查，避免同类行为再次发生；
     
   • 异议申诉：若认为行政处罚或行业惩戒不当，可在收到决定书之日起60日内申请行政复议，或6个月内直接提起行政诉讼。

行动建议：

• 立即委托律师分析《不起诉决定书》类型，评估行政与行业风险；
  
• 30日内向行政监督部门提交书面陈述申辩材料，争取从轻处理；
  
• 同步启动企业合规体系建设，降低后续监管风险。
  

如有具体案件细节（如不起诉类型、行政处罚通知内容等），可进一步提供，我将为您定制应对方案。