二审是否收取诉讼费，与一审判决程序是否合法并无直接关系，二审是否收取诉讼费主要取决于案件的性质以及二审的处理结果。以下从不同情况为你详细分析：
二审收取诉讼费的一般情况
上诉案件：根据《诉讼费用交纳办法》的规定，当事人进行民事上诉、行政上诉的，应当按照规定交纳案件受理费。这意味着，如果当事人对一审判决不服提起上诉，无论一审判决程序是否合法，二审法院在受理案件时，都会要求上诉人交纳二审案件受理费。例如，在一起合同纠纷案件中，一审法院作出了判决，一方当事人认为判决不公提起上诉，那么该当事人就需要按照规定向二审法院交纳上诉案件受理费。
二审维持原判或改判：二审法院在审理上诉案件后，如果维持原判或者改判，败诉方通常需要承担二审的诉讼费用。如果一审判决程序不合法，但二审法院认为这并不影响判决结果的正确性，从而维持原判，那么败诉方仍需承担二审的诉讼费用。反之，如果二审法院因一审程序违法而改判，且改判结果对原败诉方有利，那么诉讼费用的承担可能会根据具体情况进行调整，但一般情况下，原上诉方已交纳的诉讼费可能不会全额退还，而是根据改判结果进行部分退还或分担。
二审可能不收取或退还诉讼费的特殊情况
裁定不予受理、驳回起诉、管辖权异议的案件：根据《诉讼费用交纳办法》第八条的规定，下列案件不交纳案件受理费：（三）对不予受理、驳回起诉和管辖权异议裁定不服，提起上诉的案件。这意味着，如果一审法院作出了不予受理、驳回起诉或管辖权异议的裁定，当事人对此不服提起上诉的，二审法院不会收取案件受理费。但需要注意的是，这一规定仅适用于裁定类案件，对于判决类案件并不适用。
二审裁定撤销原判发回重审：如果二审法院认为一审判决程序违法，且这种违法情形严重影响了案件的公正审理，那么二审法院可能会裁定撤销原判，发回一审法院重审。在这种情况下，二审法院通常会退还上诉人已交纳的二审案件受理费。因为案件被发回重审意味着二审程序并未对案件的实体问题进行最终裁决，上诉人无需承担二审的诉讼费用。
针对一审判决程序不合法的建议
如果你认为一审判决程序不合法，并打算提起上诉，那么在上诉过程中，你可以向二审法院明确指出一审程序存在的违法情形，并附上相关证据材料。二审法院在审理案件时，会对一审程序的合法性进行审查。如果二审法院认定一审程序确实违法，且这种违法情形影响了案件的公正审理，那么二审法院可能会裁定撤销原判、发回重审，或者依法改判。
如果你在一审判决程序合法性方面存在疑问，或者对二审诉讼费用的交纳有进一步的问题，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细的法律建议和帮助。