关于“医院村上书记盖公章是否合法”的问题，这主要涉及到村民委员会印章的使用和管理规定。以下是我根据相关法规和政策，为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，村民委员会的印章是村级公共权力的象征，它在办理村公共事务和公益事业方面具有重要作用。因此，印章的使用和管理必须严格遵守相关规定，以确保其合法性和有效性。

根据国务院办公厅转发的民政部、公安部《关于规范村民委员会印章制发使用和管理工作的意见》中的规定，村民委员会印章的使用应当建立健全审批、登记、备案制度，并纳入村民自治章程或村规民约之中。印章的使用必须经过审批程序，且审批人与保管人一般不得为同一人，以防止乱用印章。特别是涉及贷款、承包、对外签订合同等重大问题需使用印章时，必须召开村民会议或村民代表会进行讨论，并经会议讨论同意且由村民委员会主任签字后方可使用。

针对您提到的“医院村上书记盖公章”的情况，如果这里的“公章”指的是村民委员会的印章，那么是否合法就取决于是否遵循了上述的审批和使用程序。如果村上书记在未经审批或未经村民会议、村民代表会讨论同意的情况下，擅自使用印章，那么这种行为就是不合法的，可能构成违规使用公章，甚至可能涉及违法犯罪行为。

此外，我还想强调的是，村民委员会印章的保管也至关重要。印章应当由专人保管，且保管人必须经过村民代表会议讨论决定。村党支部书记、村民委员会主任一般不宜直接保管印章，以防止权力滥用。

综上所述，医院村上书记盖公章是否合法，取决于是否遵循了村民委员会印章的审批和使用程序。如果未经审批或未经村民会议、村民代表会讨论同意，擅自使用印章，那么这种行为就是不合法的。因此，建议在使用村民委员会印章时，务必严格遵守相关规定和程序，以确保其合法性和有效性。