针对您提出的“一起案件三次取保候审两次监视居住怎么办”的问题，这确实是一个涉及刑事诉讼程序复杂性的情况。以下是我为您提供的详细分析以及建议：
一、情况分析
取保候审与监视居住的变更原因：
- 取保候审后变更为监视居住，通常是因为办案机关认为犯罪嫌疑人、被告人存在违反取保候审规定的行为，如擅自离开居住地、未报告信息变动、传讯不到案等。
- 另一种情况是案件情况发生了变化，如侦查进展中发现新的犯罪事实、证据收集变化等，使得原取保候审措施不足以保障诉讼的顺利进行。
多次变更的可能原因：
- 在您的案例中，出现了三次取保候审和两次监视居住的变更，这可能意味着案件情况复杂多变，或者犯罪嫌疑人、被告人的行为表现让办案机关对其社会危险性有持续的评估和调整。
二、应对建议
严格遵守规定：
- 无论处于取保候审还是监视居住状态，犯罪嫌疑人、被告人都应严格遵守相关规定，如不得擅自离开居住地、及时报告信息变动、随传随到等。这是避免强制措施进一步升级的关键。
积极配合办案机关：
- 犯罪嫌疑人、被告人及其家属应积极配合办案机关的工作，提供必要的协助和信息。这有助于办案机关更全面地了解案件情况，从而作出更合理的判断。
咨询专业律师：
- 面对复杂的刑事诉讼程序，建议犯罪嫌疑人、被告人及其家属及时咨询专业律师。律师能够提供专业的法律意见，帮助了解权利和义务，以及可能的法律后果和风险。
- 律师还可以协助与办案机关沟通，争取更有利的诉讼条件，如申请变更强制措施、提出辩护意见等。
关注案件进展：
- 犯罪嫌疑人、被告人及其家属应密切关注案件的进展情况，及时了解办案机关的决策和理由。这有助于更好地应对可能出现的法律问题，并作出合理的决策。
三、法律后果与风险
- 强制措施的变更可能意味着案件情况的复杂性和严重性在增加，犯罪嫌疑人、被告人可能面临更严格的法律后果。
- 因此，务必认真对待每一次强制措施的变更，积极配合办案机关的工作，并寻求专业律师的帮助以维护自身合法权益。
综上所述，面对一起案件中多次取保候审和监视居住的变更情况，犯罪嫌疑人、被告人及其家属应保持冷静、积极配合办案机关的工作、严格遵守相关规定、及时咨询专业律师并关注案件进展。这样才能更好地应对可能出现的法律问题并维护自身合法权益。