合作方是本企业股东，这一安排本身并不直接违反法律法规，但是否合规需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：

一、法律层面

1. 公司法相关规定：

   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，股东有权参与公司的经营管理，包括但不限于选举和被选举为董事、监事，参与股东会会议并行使表决权等。因此，股东作为合作方，在法律上是有依据的，只要其参与合作的行为不违反公司章程或相关法律法规，就是合法的。

2. 关联交易限制：

   • 如果合作涉及关联交易（即股东与公司之间的交易），则需要特别注意。根据《公司法》及相关规定，关联交易应当遵循公平、公正的原则，不得损害公司及其他股东的利益。如果关联交易未经过适当的审批程序或存在不公平的情况，可能会引发法律纠纷。

二、合规性角度

1. 公司章程与内部规定：

   • 除了法律法规外，公司章程和内部规定也是判断合作方作为股东是否合规的重要依据。如果公司章程或内部规定对股东作为合作方有明确的限制或要求，那么必须遵守这些规定。

2. 利益冲突与回避：

   • 当股东作为合作方时，可能会存在利益冲突的情况。例如，股东可能为了自身利益而损害公司的利益。因此，需要建立有效的利益冲突回避机制，确保合作方的行为不会损害公司及其他股东的利益。

三、实际操作建议

1. 审查合作协议：

   • 在与合作方（股东）签订合作协议时，应仔细审查协议条款，确保协议内容合法、合规，并明确双方的权利和义务。特别是要关注关联交易、利益冲突等关键条款。

2. 加强内部管理：

   • 公司应建立健全的内部管理制度，包括关联交易审批制度、利益冲突回避制度等，以确保合作方（股东）的行为符合公司章程和内部规定的要求。

3. 寻求专业法律意见：

   • 在涉及复杂法律问题时，建议寻求专业法律意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助公司规避法律风险。

四、可能的风险与后果

1. 法律纠纷风险：

   • 如果合作方（股东）的行为违反法律法规或公司章程、内部规定，可能会引发法律纠纷，给公司带来不必要的损失。

2. 声誉损害风险：

   • 不合规的合作行为可能会损害公司的声誉和形象，影响公司的长期发展。

总结来说，合作方是本企业股东这一安排本身并不直接违反法律法规，但是否合规需结合具体情况分析。在实际操作中，应仔细审查合作协议、加强内部管理，并在必要时寻求专业法律意见，以确保合作行为的合法性和合规性。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。