企业因虚开发票罪被法院认定存在真实业务部分，该部分对应的所得税是否需要补缴，需分情况讨论：

1. 真实业务部分已实际产生应税所得，且未依法申报纳税的，应当补缴所得税
   根据《企业所得税法》及实施条例，企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。若法院认定的真实业务部分确实产生了应税所得（如销售收入、服务收入等），且企业未在税法规定的期限内申报或缴纳所得税，税务机关有权要求企业补缴税款，并可能加收滞纳金或处以罚款。
   关键点：真实业务是否实际产生应税所得、是否已履行纳税申报义务。

2. 真实业务部分未产生应税所得，或已依法申报纳税的，无需补缴
   若真实业务部分属于不征税收入（如财政拨款）、免税收入（如国债利息收入），或企业已按照税法规定申报并缴纳了所得税，则无需重复补缴。此外，若真实业务部分因成本、费用等扣除后应纳税所得额为零或负数，亦无需补缴所得税。
   关键点：业务性质是否属于应税范围、是否已履行纳税义务。

3. 虚开发票部分与真实业务部分的税务处理需区分
   虚开发票行为本身可能涉及增值税、企业所得税等税种的违法处理（如补缴税款、罚款等），但法院认定的真实业务部分需独立判断其税务合规性。即使虚开发票行为被处罚，真实业务部分若符合税法规定，仍无需因虚开发票行为而补缴税款。
   例外情形：若真实业务部分因虚开发票导致成本、费用等扣除不实（如虚构成本），税务机关可能调整应纳税所得额，要求补缴税款。

建议：

• 企业应梳理真实业务部分的财务、税务资料，确认是否已依法申报纳税；
  
• 若存在未申报或申报不实情形，建议主动与税务机关沟通，补缴税款并说明情况，以降低法律风险；
  
• 虚开发票行为可能涉及刑事责任，企业需重视合规整改，避免后续风险。
  

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