企业法人因虚开发票已被刑事处罚后，税务机关仍可能对企业进行行政处罚。以下从不同角度为您详细分析：
一、刑事处罚与行政处罚的性质与目的
刑事处罚：是对犯罪行为的严厉制裁，旨在惩罚犯罪、保护社会秩序和公共利益。在虚开发票罪中，刑事处罚主要针对的是犯罪行为的严重性，如虚开金额巨大、造成国家税款重大损失等情节。
行政处罚：是税务机关对违反税收法律法规的行为进行的制裁，旨在维护税收秩序、保障国家税收收入。行政处罚的种类包括罚款、没收违法所得等，其严厉程度通常低于刑事处罚。
二、刑事处罚与行政处罚的独立性
刑事处罚与行政处罚在法律上是独立的，二者并不互相排斥。即使企业法人因虚开发票罪已被刑事处罚，税务机关仍可根据税收法律法规对企业进行行政处罚。这是因为刑事处罚和行政处罚针对的是不同的法律后果和目的。
三、虚开发票行为的行政处罚依据
根据《中华人民共和国税收征收管理法》及相关规定，虚开发票行为属于违反税收法律法规的行为，税务机关有权对其进行行政处罚。具体处罚措施包括：
没收违法所得：税务机关可以没收企业因虚开发票而获得的违法所得。
罚款：根据虚开金额的大小，税务机关可以对企业处以不同数额的罚款。例如，虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款。
四、刑事处罚与行政处罚的衔接
在实际操作中，税务机关在发现企业虚开发票行为后，通常会先进行税务稽查，并根据稽查结果决定是否移送司法机关追究刑事责任。如果企业法人已被刑事处罚，税务机关仍会继续进行税务处理，包括行政处罚。这是因为刑事处罚和行政处罚是两个独立的法律程序，各自有其独立的法律依据和程序要求。
五、企业应对建议
加强合规管理：企业应建立健全的发票管理制度，确保所有发票业务真实合法，避免虚开发票等违法行为的发生。
积极配合调查：如果企业被税务机关稽查或调查，应积极配合并提供相关证据材料，以减轻或避免行政处罚。
寻求法律帮助：如果企业面临刑事处罚或行政处罚的风险，应及时寻求专业律师的帮助，了解相关法律法规和程序要求，制定合适的应对策略。
总结来说，企业法人因虚开发票已被刑事处罚后，税务机关仍可能对企业进行行政处罚。企业应加强合规管理，积极配合调查，并在必要时寻求法律帮助以应对可能的法律风险。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。