关于文件生效日期是否以印发时间为准的问题，这确实是一个涉及公文处理和法律效力的细致问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，规范性文件中关于生效时间的表述，如“自本通知印发之日起执行”或“自本通知印发之日起停止执行”，在公文表述习惯以及各级各地的实践做法中，通常“印发之日”是包括当日的。这意味着，从文件印发的那一刻起，该文件即开始产生法律效力或停止执行。

然而，这里也存在一个重要的法律原则，即“未经公布的行政规范性文件不得作为行政管理依据”。这一原则意味着，尽管文件可能已经印发，但如果尚未公布，那么它就不能作为行政管理的依据。换句话说，文件的生效时间至少应从公布之日起算。不过，值得注意的是，现有法律法规并没有对文件生效时间的“当日”究竟具体至哪一个时间点作出具体规定，这在实际操作中可能存在一定的模糊性。

另外，您提到的《民法典》中关于“按照年、月、日计算期间的，开始的当日不计入，自下一日开始计算”的规定，这主要是针对民事法律关系的期间计算，并不能直接作为行政规范性文件管理的上位法依据。行政规范性文件的生效时间有其自身的规定和习惯。

在实际操作中，为了确保文件的合法性和有效性，以及避免可能的法律纠纷，建议文件制定机关在行文时对文件的施行日期作出更加明确细致的规定。例如，可以明确指出文件自印发之日的何时（如上午、下午或具体时刻）开始生效，或者规定文件在印发后的一定天数内（如3日、7日等）开始生效。

综上所述，文件生效日期是否以印发时间为准，在公文表述习惯和实践中通常包括印发当日，但具体生效时间还需结合文件的公布情况和相关法律法规进行综合判断。为了确保文件的合法性和有效性，建议文件制定机关在行文时对施行日期作出明确规定。