结论：多标包的政府采购项目中，第一标包成交人在其他标包废标是否合法，需根据具体情况判断，但通常不直接因第一标包成交而当然导致其他标包废标，除非存在特定违法情形或采购文件有明确规定。以下从不同角度详细分析：
一、政府采购的基本原则与规定
政府采购活动应遵循公开、公平、公正和诚实信用的原则。在多标包的政府采购项目中，每个标包通常被视为独立的采购单元，供应商可以兼投不兼中，即可以同时参与多个标包的投标，但只能中标其中一个标包（除非采购文件另有规定）。这一原则旨在确保采购活动的竞争性和效率，同时避免供应商过度集中中标，影响市场公平竞争。
二、第一标包成交与其他标包废标的关系
独立评审原则：
- 每个标包的评审应独立进行，第一标包的成交结果不应直接影响其他标包的评审和成交结果。除非采购文件中有特别规定，否则第一标包的成交人不会因其中标而自动在其他标包中废标。
废标的法定情形：
- 根据《中华人民共和国政府采购法》及相关规定，废标通常发生在以下情形：符合专业条件的供应商或者对招标文件作实质响应的供应商不足三家的；出现影响采购公正的违法、违规行为的；投标人的报价均超过了采购预算，采购人不能支付的；因重大变故，采购任务取消的。
- 第一标包的成交并不构成上述废标情形中的任何一种，因此通常不会直接导致其他标包废标。
采购文件的特别规定：
- 如果采购文件中有明确规定，如“若供应商在某一标包中中标，则自动失去在其他标包中的中标资格”，那么第一标包的成交人确实可能因该规定而在其他标包中废标。但这种情况较为特殊，且需采购文件中有明确且合理的规定作为依据。
三、实际操作中的注意事项
仔细阅读采购文件：
- 供应商在参与多标包的政府采购项目时，应仔细阅读采购文件，了解每个标包的评审标准、中标原则以及是否存在特别规定（如兼投不兼中的具体限制）。
遵守法律法规和采购文件：
- 供应商应严格遵守政府采购法律法规和采购文件的规定，避免因违规行为而导致废标或其他不利后果。
及时提出异议或投诉：
- 如果供应商认为采购过程中存在违法违规行为或采购文件的规定不合理，应及时向采购人或采购代理机构提出异议或投诉，以维护自身合法权益。
建议：在实际操作中，如果第一标包的成交人担心自己在其他标包中的中标资格受到影响，可以仔细审查采购文件中的相关规定，并在必要时向采购人或采购代理机构咨询确认。如果遇到违法违规行为或不合理规定，应及时采取法律措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。