在离婚协议中，针对婚内购买但登记在女方单独名下的车库，可以按照以下方式处理并撰写协议内容：

1. 明确车库性质与归属：

   • 首先，在离婚协议中需明确该车库虽登记在女方名下，但系在婚姻关系存续期间购买，因此原则上应视为夫妻共同财产（除非有特别约定或能证明为女方个人财产）。
   • 若双方协商一致，确认车库归女方所有，则应在协议中明确表述，例如：“双方确认，位于XX地址的车库（产权证号：XXXX），虽登记在女方名下，但系婚姻关系存续期间购买，现经双方协商一致，该车库归女方单独所有。”

2. 处理财产分割与补偿：

   • 若车库归女方所有，但男方在购买过程中有出资或贡献，双方应就财产分割及补偿事宜达成一致。可以在协议中约定：“鉴于男方在车库购买过程中的出资及贡献，女方同意向男方支付人民币XX元作为补偿，该款项于协议生效之日起XX日内支付完毕。”
   • 若双方均无异议，且车库完全归女方所有，无需对男方进行补偿，则可在协议中明确：“双方确认，车库归女方所有，男方对此无异议，且不要求任何形式的补偿。”

3. 约定过户与协助义务：

   • 为确保车库产权的顺利转移，双方应在协议中约定过户事宜。例如：“女方应在本协议生效后XX日内，负责办理车库的产权过户手续，将车库产权变更至女方名下。男方应提供必要的协助，包括但不限于签署相关文件、提供身份证明等。”

4. 明确违约责任：

   • 为防止一方不履行协议义务，双方应约定违约责任。例如：“若任何一方违反本协议约定，未按时履行过户或支付补偿款等义务，应向守约方支付违约金人民币XX元，并赔偿因此造成的损失。”

5. 其他条款：

   • 双方还可以在协议中约定其他相关事宜，如车库内物品的归属、车库使用权的限制等。

示例条款： “双方确认，位于XX地址的车库（产权证号：XXXX），虽登记在女方名下，但系婚姻关系存续期间购买，现经双方协商一致，该车库归女方单独所有。女方应在本协议生效后XX日内，负责办理车库的产权过户手续，将车库产权变更至女方名下。男方应提供必要的协助。鉴于男方在车库购买过程中的出资及贡献，女方同意向男方支付人民币XX元作为补偿，该款项于协议生效之日起XX日内支付完毕。若任何一方违反本协议约定，应向守约方支付违约金人民币XX元，并赔偿因此造成的损失。”

在撰写离婚协议时，务必确保条款清晰、明确，且符合双方的真实意愿。如有需要，建议咨询专业律师以确保协议的合法性和有效性。我是{lawyerName}律师，擅长处理多领域法律实务问题，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。