公民认为政府部门决定意见不合法不服时，一般不可以直接越级网上信访，而应遵循法定的行政复议或行政诉讼等救济途径。以下是对此问题的详细分析：
一、信访与行政复议、行政诉讼的区别
信访：信访是公民、法人或者其他组织采用书信、电子邮件、传真、电话、走访等形式，向各级人民政府、县级以上人民政府工作部门反映情况，提出建议、意见或者投诉请求，依法由有关行政机关处理的活动。信访主要是一种民意表达和情况反映机制，并不直接解决行政争议。
行政复议：行政复议是指公民、法人或者其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯其合法权益，依法向法定的行政复议机关提出复议申请，行政复议机关依照法定程序对被申请的具体行政行为进行合法性、适当性审查，并作出行政复议决定的一种法律制度。行政复议是解决行政争议的一种重要方式，具有高效、便捷、低成本等特点。
行政诉讼：行政诉讼是指公民、法人或者其他组织认为行政机关和行政机关工作人员的行政行为侵犯其合法权益，有权依照本法向人民法院提起诉讼。行政诉讼是解决行政争议的最后一道防线，具有权威性、公正性和终局性。
二、为何不能越级网上信访
法定程序限制：根据相关法律法规，信访应当遵循属地管理、分级负责，谁主管、谁负责的原则。这意味着公民应当首先向作出具体行政行为的行政机关的上一级行政机关或者本级人民政府提出信访请求，而不是直接越级信访。
救济途径的明确性：对于认为政府部门决定意见不合法的公民，法律已经明确规定了行政复议和行政诉讼等救济途径。这些途径具有明确的程序、时限和法律效力，能够更有效地保障公民的合法权益。
信访的局限性：信访虽然是一种重要的民意表达和情况反映机制，但其并不直接解决行政争议。而且，越级信访可能会扰乱正常的信访秩序，增加处理难度和成本，不利于问题的及时解决。
三、建议的救济途径
申请行政复议：公民可以在知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。行政复议机关将对被申请的具体行政行为进行合法性、适当性审查，并作出行政复议决定。
提起行政诉讼：如果公民对行政复议决定不服，或者认为行政机关的具体行政行为直接侵犯其合法权益，可以在知道或者应当知道该具体行政行为之日起六个月内（特殊情况下可延长）向人民法院提起行政诉讼。
四、特殊情况下的处理
在极少数特殊情况下，如公民面临紧急情况或者无法通过正常途径获得救济时，可以考虑通过其他合法途径寻求帮助，如向媒体反映、寻求法律援助等。但这些途径并不是法定的救济方式，且可能存在一定的风险和不确定性。因此，在采取这些措施前，建议公民先咨询专业律师的意见。
总结来说，公民在认为政府部门决定意见不合法不服时，应遵循法定的行政复议或行政诉讼等救济途径，而不是直接越级网上信访。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。