结论：在房产已在执行中，但双方诉讼离婚达成调解协议又分割了房产的情况下，法院不一定会依职权撤销调解，这取决于具体情形和法律规定。以下从不同角度进行分析：
一、调解协议的效力与执行程序的关系
调解协议的生效：
- 诉讼离婚中达成的调解协议，一旦经法院确认并制作调解书，即具有法律效力，对双方当事人具有约束力。
- 调解书与判决书具有同等法律效力，一方不履行，另一方可以申请法院强制执行。
执行程序的独立性：
- 执行程序是基于生效法律文书（如调解书、判决书）而启动的，旨在实现法律文书所确定的内容。
- 房产已在执行中，说明执行程序已经启动，且可能正在进行中。
调解协议与执行程序的冲突解决：
- 如果调解协议中关于房产的分割与执行程序中的执行标的存在冲突，法院不会直接依职权撤销调解协议。
- 相反，法院可能会根据具体情况，如调解协议是否违反法律规定、是否损害第三人利益等，来决定是否中止执行、变更执行标的或采取其他措施。
二、法院依职权撤销调解的情形
调解违反自愿原则：
- 如果调解协议是在一方或双方非自愿的情况下达成的，法院可以依职权撤销调解。
- 但这需要当事人提供充分证据证明调解过程中存在胁迫、欺诈等情形。
调解内容违法：
- 如果调解协议的内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者损害国家、集体或第三人利益，法院可以依职权撤销调解。
- 例如，调解协议中关于房产的分割可能涉及非法转移财产、逃避债务等情形。
调解程序违法：
- 如果调解程序违反法律规定，如调解员未依法回避、调解过程未公开等，法院也可能依职权撤销调解。
三、具体情形下的处理建议
如果调解协议合法有效：
- 双方应遵守调解协议的内容，房产的分割应按照调解协议执行。
- 如果执行程序中的执行标的与调解协议中的房产分割存在冲突，可以与执行法院沟通，说明情况，请求法院根据调解协议调整执行标的。
如果调解协议存在违法或违反自愿原则的情形：
- 一方可以向法院提出撤销调解的申请，并提供充分证据证明调解过程中存在违法或违反自愿原则的情形。
- 法院将依法审查，并作出是否撤销调解的决定。
如果执行程序已启动且无法中止或变更：
- 双方可以协商解决房产分割问题，并达成新的协议。
- 如果协商不成，可以等待执行程序结束后，再根据实际情况通过诉讼或其他方式解决房产分割纠纷。
进一步思考：在处理此类案件时，应充分考虑调解协议的效力、执行程序的独立性以及法院依职权撤销调解的情形。如果双方对调解协议或执行程序存在争议，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。