结论：在约定了有效的仲裁条款后，当事人一般应通过仲裁解决争议，而不能向法院起诉。但在特定情况下，如仲裁条款无效、双方放弃仲裁协议或仲裁裁决被撤销或不予执行时，当事人可以向法院提起诉讼。

一、仲裁条款的法律效力与选择

双方当事人在合同中约定了仲裁条款，或者事后达成了书面仲裁协议，并且该仲裁事项属于法律规定的可仲裁范围，那么当发生争议时，应当按照约定申请仲裁，而不是向法院提起诉讼。这是因为仲裁和诉讼是并列的两种解决争议的方式，它们各自有独立的程序和规则。一旦选择了仲裁，就意味着接受了仲裁的规则和程序，以及仲裁裁决的结果。

二、仲裁条款排除法院司法管辖权

仲裁协议具有排除法院司法管辖权的法律效力。这意味着，如果当事人之间已经存在有效的仲裁条款，那么当出现约定范围内的争议时，应当通过仲裁途径解决，而不能再向法院起诉。这是仲裁制度的基本原则之一，也是保障仲裁独立性和权威性的重要体现。

三、特殊情况下的法院诉讼

尽管仲裁条款具有排除法院司法管辖权的效力，但在以下特殊情况下，当事人仍然可以向法院提起诉讼：

1. 仲裁条款无效：

   • 如果仲裁条款本身存在法定无效的情形，如约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围（例如涉及婚姻、收养、监护、抚养、继承等纠纷）、无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议、一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议等，那么该仲裁条款自始无效，当事人可以向法院起诉。
   • 仲裁机构不明确或不存在也可能导致仲裁条款无效。例如，如果合同中约定的仲裁机构名称不准确或该机构已不存在，且双方未能就新的仲裁机构达成一致意见，那么一方也可以向法院提起诉讼。

2. 放弃仲裁协议：

   • 双方当事人可以通过明示或默示的方式放弃仲裁协议。例如，在仲裁程序启动前，双方一致同意将争议提交法院解决，或者以实际行动表明不再履行仲裁协议（如一方直接向法院起诉，而另一方在首次开庭前未提出异议），那么此时当事人可以向法院起诉。

3. 仲裁裁决被撤销或不予执行：

   • 如果仲裁裁决作出后，该裁决被有管辖权的法院依法撤销或者裁定不予执行，那么当事人可以就该争议向法院提起诉讼。这是因为在这种情况下，仲裁裁决已经失去了法律效力，当事人需要通过其他途径解决争议。

四、实际操作建议

1. 审查仲裁条款的有效性：在签订合同时，应确保仲裁条款明确、具体，并符合法律规定的仲裁范围。如果合同中已经约定了仲裁条款，当事人在发生争议时应首先审查该条款的有效性。

2. 遵守仲裁程序：如果仲裁条款有效，当事人应按照约定申请仲裁，并遵循仲裁的规则和程序。在仲裁过程中，应积极配合仲裁机构的工作，提供必要的证据和材料。

3. 保留相关证据和材料：无论选择仲裁还是诉讼，当事人都应保留好与争议相关的证据和材料。这些证据和材料在解决争议过程中可能起到关键作用。

4. 灵活应对特殊情况：在实际操作中，如果遇到仲裁条款无效、双方放弃仲裁协议或仲裁裁决被撤销或不予执行等特殊情况，当事人应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并灵活应对。

示例：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，并在合同中约定了仲裁条款。后来，双方因合同履行问题发生争议。如果仲裁条款有效且双方没有放弃仲裁协议，那么甲乙双方应通过仲裁解决争议。但是，如果仲裁条款因约定的仲裁机构不存在而无效，或者双方在仲裁程序启动前一致同意将争议提交法院解决，那么甲乙双方就可以向法院提起诉讼。

总之，当事人在约定了有效的仲裁条款后，一般应通过仲裁解决争议。但在特定情况下，如仲裁条款无效、双方放弃仲裁协议或仲裁裁决被撤销或不予执行时，当事人可以向法院提起诉讼。在实际操作中，当事人应根据具体情况灵活应对，确保自身权益得到有效维护。