结论前置：每天万分之五的违约金是否合法，不能一概而论，需结合具体合同类型、实际损失情况、法律法规的强制性规定以及合同双方的自愿性等多种因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、合同约定的有效性
法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。这意味着，双方有权在合同中约定违约金的数额或计算方式。
双方自愿：如果合同双方在平等、自愿的基础上约定了违约金为每天万分之五，且该约定不违反法律法规的强制性规定，也不损害国家、集体或第三人的利益，则该约定通常是合法有效的。
二、法律法规的限制与调整
不得违反强制性规定：虽然合同双方可以自由约定违约金，但这种约定不能违反法律、行政法规的强制性规定。例如，在某些特殊领域，如金融借款合同中，违约金与利息、复利等总计不能超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍。
过高或过低的调整：
实际损失的考量：法院或仲裁机构在调整违约金时，会综合考虑实际损失、合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等因素。因此，每天万分之五的违约金是否合法，还需结合这些因素进行具体分析。
三、不同合同类型下的合法性分析
一般民事合同：在一般的民事合同关系中，每天万分之五的违约金比例通常被认为是合理的，只要该约定是双方真实意思表示，且不存在欺诈、胁迫等导致合同可撤销的情形。
金融借款合同等特殊领域：在金融借款合同纠纷中，需特别注意违约金与其他费用（如利息、复利）的总和不得超过合同成立时一年期LPR的四倍。若超出此标准，超出部分可能不会得到法院的全部支持。
四、实际操作与建议
合同约定明确：在实际操作中，合同双方应确保对违约金的计算方式、数额等有明确的约定，以避免后续的争议。
及时调整：如果一方认为约定的违约金不合理，应及时向法院或仲裁机构提出请求，以便根据实际情况进行适当调整。
证据准备：在诉讼或仲裁过程中，双方应充分准备相关证据，以证明自己的主张，如实际损失的大小、违约行为的严重程度等。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，约定如果甲方逾期交货，需按每天万分之五的比例向乙方支付违约金。若因甲方逾期交货给乙方造成了实际损失，且该损失与每天万分之五的违约金比例相当或更低，则该约定通常是合法有效的。然而，如果实际损失远低于此比例，乙方可能会请求法院减少违约金数额。
总结与建议：每天万分之五的违约金是否合法，需根据具体合同及相关法律规定来确定。在签订合同时，双方应充分考虑实际损失情况、合同类型及法律法规的要求，合理约定违约金比例或数额。若发生违约纠纷，建议直接向我咨询，我会根据具体情况进行法律分析和策略制定。