结论：店家要求按单次扣费的做法不一定合理，您有权根据实际情况与店家协商退款事宜，若协商不成可通过法律途径解决。以下从不同角度进行分析：

1. 从合同角度分析
   • 当您在美妆店购买护理套盒时，您与店家之间形成了买卖合同关系。如果套盒尚未使用，您要求退款属于解除合同的行为。在这种情况下，除非合同中有明确约定在闭店等特定情形下退款需按单次扣费，否则店家单方面要求按单次扣费缺乏合同依据。
   • 若套盒已经部分使用，店家按单次扣费是否合理，要看合同中对于使用后退款的相关约定。如果合同没有约定或者约定不明确，那么店家不能随意按单次扣费，而应该根据实际使用情况，结合公平原则来确定退款金额。例如，可以按照已使用次数占总次数的比例来扣除相应费用后退款。
2. 从消费者权益保护角度分析
   • 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》，消费者享有公平交易的权利。店家在闭店的情况下要求按单次扣费，如果这种扣费方式明显不合理，加重了您的负担，损害了您的公平交易权，那么这种要求是不合法的。
   • 您作为消费者，有权要求店家提供合理的退款方案。如果店家拒绝提供合理退款方案，您可以向当地的消费者协会投诉，消费者协会会介入调解，维护您的合法权益。
3. 应对建议
   • 与店家协商：您可以先与店家友好沟通，向店家说明按单次扣费不合理的原因，要求店家提供合理的退款方案，例如按照未使用部分的比例退款。在协商过程中，您可以保留好购买凭证、与店家的沟通记录等证据。
   • 向相关部门投诉：如果协商无果，您可以向当地的市场监督管理部门或者消费者协会投诉。投诉时，您需要提供详细的购买信息、店家的不合理要求以及相关证据，以便相关部门进行调查和处理。
   • 通过法律途径解决：如果投诉后问题仍未得到解决，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益，例如向法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明店家的行为不合理，以及您因此遭受的损失。