是的，用来讨要公司赔偿的身份证复印件应当注明用途。这样做主要是为了保护个人信息安全，防止身份证复印件被滥用。以下是从不同角度的详细分析：
法律层面：
- 根据《中华人民共和国居民身份证法》的相关规定，公民在使用居民身份证或其复印件时，应当注意保护个人信息，防止被非法获取或滥用。
- 注明用途可以视为一种自我保护措施，有助于在身份证复印件被不当使用时，作为证据证明自己并非故意泄露信息或参与非法活动。
实际操作层面：
- 在向公司提交身份证复印件以讨要赔偿时，可以在复印件上明确标注“仅用于讨要XX公司赔偿事宜，他用无效”等字样。
- 这样做可以限制身份证复印件的使用范围，降低被用于其他非法目的的风险。
风险防范层面：
- 如果不注明用途，身份证复印件可能被公司或其他第三方用于其他未经授权的活动，如办理贷款、开设银行账户等，从而给个人带来不必要的法律风险和经济损失。
- 注明用途后，即使身份证复印件被不当获取，也能在一定程度上减少被滥用的可能性，因为接收方会明确知道该复印件的特定用途。
建议：
- 在提交身份证复印件时，务必注明用途，并尽量使用黑色签字笔书写，以确保字迹清晰、不易褪色。
- 如果可能的话，可以在注明用途的同时，加盖个人印章或签名，以增加复印件的防伪性。
- 保留好提交身份证复印件的凭证，如快递单、邮件发送记录等，以便在需要时证明自己已采取合理措施保护个人信息。
如有其他关于讨要公司赔偿或个人信息保护的法律问题，欢迎直接向我咨询。