在民事诉讼中，当原告公司需要提交法人身份证复印件作为诉讼材料时，为了确保该复印件的合法性和安全性，避免被用于非诉讼目的，可以在法人身份证复印件上明确注明其用途。具体来说，可以按照以下方式操作：

1. 注明用途：在法人身份证复印件的空白处，手写或打印上“此复印件仅用于XX法院（具体法院名称）审理的XX案件（具体案号或案件名称）作为原告公司法人身份证明之用，他用无效”等字样。这样，即使该复印件被不慎泄露或误用，也能明确其合法用途，减少潜在的法律风险。

2. 加盖公章：在注明用途后，建议原告公司在复印件上加盖公司公章，以进一步确认该复印件的合法性和真实性。公章的加盖可以视为公司对复印件内容的认可和确认，有助于增强其在诉讼中的证明力。

3. 保留原件核对：在提交复印件的同时，原告公司应保留好法人身份证的原件，以备法院或对方当事人核对。这有助于确保复印件与原件的一致性，避免因复印件与原件不符而引发的法律纠纷。

额外提示：

• 在民事诉讼中，除了法人身份证复印件外，原告公司还需要提交其他相关证据材料，如民事起诉状、营业执照复印件等。这些材料也应按照法院的要求进行准备和提交。
• 原告公司应确保所提交的所有材料都是真实、合法、有效的。如果提交虚假材料或伪造证据，将可能面临法律责任和诉讼风险。

综上所述，原告公司在提交法人身份证复印件时，应明确注明其用途并加盖公章，以确保复印件的合法性和安全性。同时，也应按照法院的要求准备和提交其他相关证据材料，以确保诉讼的顺利进行。