当您发现施工方存在不合格施工的情况，并希望通过法律途径来维护自身权益时，可以按照以下详细步骤进行操作：

一、全面且细致地收集证据

1. 合同文件：首先，要仔细查阅与施工方签订的施工总承包合同、补充协议等，这些文件是明确双方权利义务的核心依据，特别是关于施工要求、质量标准、工期、价款支付等关键内容。

2. 施工指令与通知：整理您向施工方发出的所有书面施工指令、通知等，这些文件能够证明您对施工的具体要求及标准。

3. 施工过程资料：

   • 施工图纸：作为设计要求和施工标准的直观展示，是判断施工是否合格的重要依据。
   • 工程进度报告与日志：记录施工过程中的实际情况，特别是与您要求不符的部分，有助于揭示施工方的违约行为。
   • 现场照片与视频：通过直观的影像资料，反映施工现场不符合要求的部位和情况，增强证据的说服力。

4. 沟通记录：包括会议纪要、电子邮件、短信、微信聊天记录等，这些记录能够证明您曾明确要求施工方按标准施工，而施工方未执行。

5. 质量检测报告：如有第三方机构出具的工程质量检测报告，且结果显示不符合标准，这将是有力的证据。

6. 额外费用支出凭证：因施工方未按要求施工导致的额外支出，如整改费用、延误工期造成的损失等，相关发票和付款记录也是重要的证据。

二、准确确定管辖法院

根据《民事诉讼法》及相关司法解释，建设工程施工合同纠纷一般由工程所在地的人民法院专属管辖。因此，您需要明确工程所在地，以确定具体的管辖法院。

三、精心撰写起诉状

1. 原被告信息：详细列明您（原告）和施工方（被告）的基本信息，包括名称、住所地、法定代表人及联系方式等。

2. 明确诉讼请求：

   • 要求施工方继续履行合同，并达到您要求的施工标准；
   • 如无法通过整改达标，可请求解除合同、返还已付工程款，并赔偿因此造成的损失；
   • 要求施工方承担诉讼费、鉴定费等相关费用。

3. 事实与理由：清晰阐述合同签订背景、主要内容，详细说明施工方未按要求施工的事实经过、具体表现及其给您造成的损失和违约后果。

四、正式立案与诉讼流程

1. 准备材料：准备起诉状一式多份（根据被告人数+法院留存份数确定）及证据材料复印件，前往管辖法院的立案庭提交立案申请。

2. 缴纳诉讼费：法院将审查材料，符合立案条件的将受理并通知缴纳诉讼费；不符合条件的将告知补充或修改材料。

3. 参与诉讼程序：

   • 送达与答辩：关注法院送达情况，及时了解被告的答辩意见。
   • 证据交换与庭前准备：按法院安排进行证据交换，准备好证据原件及庭审中可能用到的材料，预测被告抗辩观点并准备应对策略。
   • 出庭审理：按时参加庭审，陈述案件事实、出示证据、进行质证和辩论，清晰准确地表达自己的观点和诉求。
   • 接受调解或判决：在诉讼过程中，法院可能组织调解。若调解成功，则达成和解协议；若调解不成，则等待法院判决。

五、执行判决

如法院判决支持您的诉讼请求，施工方需在规定期限内履行义务。若施工方拒不履行，您可在规定时间内向法院申请强制执行，通过法律手段维护自身权益。

注意事项与建议

• 在整个起诉过程中，鉴于案件的复杂性和专业性，建议您聘请专业律师提供法律帮助，以提高胜诉几率并确保自身权益得到充分保障。
• 保持冷静和理性，依法维权，避免采取过激行为或非法手段。
• 诉讼过程可能涉及经济成本和时间消耗，需谨慎考虑后决策。

通过以上步骤，您可以有效地通过法律途径维护自己在施工合同纠纷中的合法权益。