检察院不予起诉后，单位是否会处理取决于具体情形和单位性质，但通常检察院的不起诉决定会触发一系列法律上的后续处理措施，这些措施可能间接影响单位对被不起诉人的处理。以下从多个角度进行详细分析：
一、检察院不予起诉的类型及法律效果
法定不起诉：
- 情形：根据《刑事诉讼法》第十六条，若案件存在情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪；犯罪已过追诉时效期限；经特赦令免除刑罚；依照刑法告诉才处理的犯罪没有告诉或撤回告诉；犯罪嫌疑人、被告人死亡；或其他法律规定免予追究刑事责任等六种情形，检察院应作出不起诉决定。
- 法律效果：被不起诉人自始不被视为犯罪，其人身自由、名誉等权利得到保障，强制措施应立即解除，且不留犯罪记录。对于单位而言，若被不起诉人是其员工，单位通常不会因此对其进行纪律处分或解雇，除非该行为同时违反了单位内部规章制度。
酌定不起诉：
- 情形：对于犯罪情节轻微，依法不需判处刑罚或可免除刑罚的情况，如防卫过当、避险过当、犯罪预备、中止、从犯、胁从犯等，检察院可作出不起诉决定。
- 法律效果：虽不起诉，但不绝对否定犯罪嫌疑人的行为构成犯罪。检察院可根据情况对被不起诉人进行训诫、责令具结悔过、赔礼道歉、赔偿损失，或由主管部门给予行政处罚或行政处分。对于单位而言，若被不起诉人的行为违反了单位内部规章制度，单位仍可能根据规章制度对其进行纪律处分，如警告、罚款、降职、解雇等。
证据不足不起诉：
- 情形：依据《刑事诉讼法》第一百七十五条第四款，对于二次补充侦查后仍认为证据不足的案件，检察院应作出不起诉决定。
- 法律效果：被不起诉人不会受刑事处罚，应立即释放（如在押），且未来若发现新证据符合起诉条件时，检察院可重新提起公诉。对于单位而言，由于证据不足，单位通常不会直接对被不起诉人进行处理，但会密切关注案件进展，若后续发现新证据，单位可能会根据新情况重新评估并采取相应措施。
二、检察院不予起诉后的单位处理建议
审查内部规章制度：
- 单位应首先审查其内部规章制度，确定被不起诉人的行为是否违反了相关规定。若违反，单位可根据规章制度进行相应处理。
考虑社会影响与单位形象：
- 即使检察院不予起诉，被不起诉人的行为仍可能对社会和单位形象造成负面影响。单位在处理时，应综合考虑社会影响和单位形象，采取适当措施以维护单位声誉。
关注案件后续进展：
- 单位应密切关注案件的后续进展，若检察院重新提起公诉或发现新证据，单位应及时调整处理策略，确保合规合法。
三、检察院不予起诉后的其他法律后果
行政处罚或处分：
- 根据《刑事诉讼法》第一百七十七条，对于需要给予行政处罚、处分或没收违法所得的被不起诉人，检察院应提出检察意见，移送相关主管机关处理。这可能间接影响单位对被不起诉人的处理，如单位需配合行政机关进行调查或执行处罚决定。
被害人救济途径：
- 被害人不服不起诉决定的，可在收到决定书后七日内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。若被害人向人民法院起诉，单位可能需作为证人或相关方参与诉讼。
总结来看，检察院不予起诉后，单位是否会处理取决于具体情形和单位性质。单位应首先审查内部规章制度，确定被不起诉人的行为是否违反了相关规定，并综合考虑社会影响和单位形象，采取适当措施。同时，单位应密切关注案件的后续进展，确保合规合法。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。