结论前置：在设定抵押权的在建工程变现后，工程款通常能够优先受偿，但这一优先权并非绝对，需结合具体法律情形和条件进行判断。
法律背景与依据
工程款优先受偿权的法定性：
- 根据《中华人民共和国民法典》第八百零七条，发包人未按照约定支付价款的，承包人可以催告发包人在合理期限内支付价款。发包人逾期不支付的，除根据建设工程的性质不宜折价、拍卖外，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以请求人民法院将该工程依法拍卖。建设工程的价款就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。这一规定明确了工程款优先受偿权的法律地位。
抵押权的优先顺序：
- 同时，根据《中华人民共和国民法典》第四百一十四条，同一财产向两个以上债权人抵押的，拍卖、变卖抵押财产所得的价款依照登记的时间先后确定清偿顺序。这意味着，抵押权的优先受偿顺序通常与其登记时间相关。
最高法批复的确认：
- 《最高人民法院关于建设工程价款优先受偿权问题的批复》也进一步确认了建筑工程承包人的优先受偿权优于抵押权和其他债权。
具体情形分析
工程款优先受偿权的行使条件：
- 承包人行使工程款优先受偿权需满足一定条件，如存在合法有效的建设工程合同、建设工程已竣工或具备竣工条件、工程价款已确定且已届清偿期等。
- 此外，承包人行使优先受偿权的期限通常为六个月，自发包人应当给付建设工程价款之日起算。超过此期限未行使的，将丧失优先受偿的权利。
抵押权与工程款优先受偿权的冲突：
- 在在建工程上同时存在抵押权和工程款优先受偿权时，根据法律规定，工程款优先受偿权通常优先于抵押权。
- 但需注意的是，如果抵押权已依法登记且承包人无法充分证明其优先受偿权的成立及范围，可能会影响其优先受偿的主张。
特殊情形下的优先受偿顺序：
- 在破产情形下，根据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定，对破产人的特定财产享有担保权的权利人（如抵押权人）对该特定财产享有优先受偿的权利。但在此情形下，工程款优先受偿权仍可能基于法律特别规定而优先于抵押权。
- 另外，如果购房者在法院查封前已签订有效合同、支付全部或部分房款并合法占有房屋，其权益也可能优先于抵押权。
法律建议
对于承包人：
- 在签订建设工程合同时，应明确约定工程价款的支付方式、期限及违约责任等条款，以保障自身权益。
- 在工程竣工或具备竣工条件后，应及时与发包人进行结算并确认工程价款。
- 如发包人逾期不支付工程价款，承包人应及时行使工程款优先受偿权，避免超过行使期限。
对于抵押权人：
- 在接受在建工程作为抵押物时，应充分了解该工程上是否存在工程款优先受偿权等优先权情况。
- 如存在优先权情况，应与抵押人协商确定合理的抵押担保范围及清偿顺序等条款。
- 在抵押权实现时，如遇到工程款优先受偿权等优先权冲突情况，应及时寻求法律途径解决。
总结与提示：在建工程变现后工程款能否优先受偿取决于多种因素，包括工程款优先受偿权的行使条件、抵押权与工程款优先受偿权的冲突以及特殊情形下的优先受偿顺序等。因此，在处理此类问题时，建议根据具体情况咨询专业律师以获取更准确的法律意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。