行政处罚案件因程序问题确实有可能被撤销并重新立案，但需满足特定条件并遵循法定程序。以下从多个角度为您详细分析：

一、因程序问题撤销行政处罚的法律依据

根据《中华人民共和国行政诉讼法》第七十条，行政行为若存在“违反法定程序”的情形，人民法院将判决撤销或者部分撤销，并可以判决被告重新作出行政行为。这意味着，如果行政处罚案件在程序上存在违法或不当，如未告知当事人权利、未举行听证等，该处罚决定有可能被法院撤销。

二、重新立案的条件

在行政处罚决定被撤销后，若行政机关认为仍需对违法行为进行处罚，可以重新立案。但重新立案需满足以下条件：

1. 存在新的违法事实或证据：虽然原处罚决定因程序问题被撤销，但若行政机关发现了新的违法事实或证据，足以支持重新立案，则可以依法进行。
2. 合法依据：重新作出的处罚必须符合现行有效的法律、法规，确保处罚的合法性和正当性。
3. 程序合规：重新立案必须严格遵循行政处罚的程序要求，包括立案、调查取证、告知、听证、决定等环节，确保程序的合法性和当事人的合法权益。

三、重新立案的程序

1. 立案审批：行政机关需撰写立案审批表，详细说明重新立案的原因、涉及的当事人基本情况、初步掌握的违法事实等，并报行政机关负责人审批。
2. 调查取证：立案后，行政机关应按照法定程序开展调查取证工作，重新收集与案件相关的各类证据，并确保调查过程的合法性和当事人的合法权益。
3. 告知与听证：在作出行政处罚决定前，行政机关应依法告知当事人拟作出的行政处罚内容及事实、理由、依据，并告知当事人享有的陈述、申辩、要求听证等权利。如当事人要求听证，行政机关应组织听证。
4. 作出处罚决定：经过调查取证、听取当事人陈述申辩或举行听证等程序后，行政机关根据查明的事实和相关法律规定，作出新的行政处罚决定。

四、注意事项

1. 避免重复处罚：根据《中华人民共和国行政处罚法》第二十九条，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。因此，在重新立案时，需确保不构成重复处罚。
2. 保障当事人权利：在重新立案和处罚过程中，行政机关需充分保障当事人的陈述申辩权、听证权等合法权益，确保处罚决定的公正性和合理性。
3. 时效问题：根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，期限延长至五年）。因此，在重新立案时，需注意行政处罚的追诉时效。

五、实例说明

假设某企业因环保违规被处以罚款，但后因调查取证程序违法被法院撤销处罚。行政机关在撤销处罚后，经补充调查获取了新证据（如监测数据、现场照片等），证明该企业确实存在违规行为。此时，行政机关可依法重新立案，并依据新证据作出处罚决定。

总结来说，行政处罚案件因程序问题被撤销后，若满足重新立案的条件并遵循法定程序，行政机关是可以重新立案并进行处罚的。但在此过程中，需严格遵守法律规定，确保程序的合法性和当事人的合法权益。如果您在行政处罚案件中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。