在车祸诉讼中告赢了对方公司，赔偿款一般由对方公司的保险公司或对方公司自身来支付，具体取决于保险覆盖情况和赔偿金额。以下是对此问题的详细分析：
保险公司赔偿：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千二百一十三条的规定，机动车发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任的，先由承保机动车强制保险的保险人在强制保险责任限额范围内予以赔偿。这意味着，如果对方公司的车辆投保了交强险，那么在交强险的赔偿限额内，赔偿款将由保险公司支付。
- 如果交强险的赔偿限额不足以覆盖全部损失，且对方公司的车辆还投保了商业保险，那么超出交强险赔偿限额的部分，将由承保商业保险的保险人按照保险合同的约定予以赔偿。
对方公司赔偿：
- 如果对方公司的车辆没有投保商业保险，或者商业保险的赔偿限额仍然不足以覆盖全部损失，那么剩余的赔偿款将由对方公司自行承担。
- 在某些情况下，如果对方公司存在故意或重大过失，且这种过失与事故的发生有直接关系，那么对方公司可能需要承担全部的赔偿责任，即使其车辆已经投保了相应的保险。
在实际操作中，赔偿款的支付流程可能如下：
- 法院判决：首先，法院会根据双方提供的证据和法律规定，作出判决，确定赔偿金额和赔偿责任方。
- 保险公司理赔：如果判决确定赔偿责任在保险公司，那么保险公司将在收到判决后，按照判决确定的金额和期限，向受害方支付赔偿款。
- 对方公司支付：如果判决确定赔偿责任在对方公司，且对方公司没有投保或保险赔偿不足，那么对方公司将在收到判决后，按照判决确定的金额和期限，向受害方支付赔偿款。如果对方公司不履行判决，受害方可以申请法院强制执行。
建议：
- 在处理车祸赔偿问题时，建议受害方保持冷静，及时收集并保存好相关证据，如医疗记录、事故现场照片、证人证言等。
- 如果可能的话，受害方可以寻求专业律师的帮助，以便更好地了解自己的权益和赔偿流程，以及如何有效地与保险公司和对方公司进行协商和诉讼。
如果您在车祸赔偿方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。