结论：政府作为原告因拆迁协议引起的纠纷，既可能属于民事诉讼，也可能属于行政诉讼，具体取决于纠纷的性质和涉及的主体。以下是对此问题的详细分析：
一、民事诉讼的情况
平等主体间的合同纠纷：
- 当拆迁人与被拆迁人（如房屋所有权人）作为平等民事主体签订补偿协议时，若因协议履行产生争议，如补偿金额未兑现、安置房交付标准不符等，双方可通过民事诉讼解决。此类纠纷的核心在于合同权利义务的认定与履行。
- 举例：政府作为拆迁方与被拆迁户签订了补偿协议，但交房时发现房屋面积与协议约定不符，此时被拆迁户可提起民事诉讼，要求政府按协议履行或赔偿损失。
涉及相邻关系的纠纷：
- 在拆迁过程中，若因施工影响了相邻房屋的通风、采光、通行等权益，导致相邻不动产权利人之间产生争议，这类纠纷也应通过民事诉讼解决。
- 举例：拆迁工地的脚手架遮挡了相邻居民的采光，居民可提起民事诉讼，要求政府或施工方停止侵害并赔偿损失。
二、行政诉讼的情况
行政机关单方变更或解除协议引发的争议：
- 若行政机关在缺乏法定事由的情况下单方面修改补偿方案或终止协议，被拆迁人可提起行政诉讼。此时争议焦点在于行政行为合法性的审查。
- 举例：政府以公共利益为由强制调整已生效的补偿标准，被拆迁人认为该行为违法，可提起行政诉讼。
兼具行政性与协议性行为的特殊情形：
- 在国有土地上房屋征收中，政府作为征收主体签订的补偿协议具有行政协议属性。当行政机关存在超越职权、违反法定程序等违法情形时，相关纠纷需通过行政诉讼解决。
- 举例：政府未依法进行社会稳定风险评估即变更补偿方案，被拆迁人可提起行政诉讼，请求法院审查该行为的合法性。
行政机关不履行法定职责引发的纠纷：
- 在拆迁过程中，若被拆迁人认为行政机关应当履行某些法定职责但未履行，如未依法对拆迁活动进行监管，导致被拆迁人的合法权益受到侵害时，也可提起行政诉讼。
- 举例：拆迁过程中存在暴力拆迁行为，被拆迁人向相关行政机关报案并要求制止和查处，但行政机关未采取任何措施。此时，被拆迁人可提起行政诉讼，要求行政机关履行职责并赔偿损失。
三、处理建议
明确争议性质：
- 首先要仔细分析纠纷的具体情况，判断是属于与拆迁方（可能是企业或其他平等主体）之间的民事争议，还是与行政机关之间的行政争议。如果是对行政机关的具体行政行为不满，一般应选择行政诉讼；如果是与其他主体之间关于协议内容的争议，则倾向于民事诉讼。
收集并保留证据：
- 无论选择哪种诉讼途径，当事人都应收集和保留好相关证据，如拆迁协议、补偿标准文件、沟通记录、现场照片等，以支持自己的主张。
咨询专业律师：
- 拆迁纠纷涉及复杂的法律关系和程序，建议当事人在处理此类纠纷时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。
综上所述，政府作为原告因拆迁协议引起的纠纷既可能属于民事诉讼，也可能属于行政诉讼。当事人在处理此类纠纷时，应综合考虑各方面因素，并依据相关法律法规选择适当的诉讼途径。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。