结论：单位不认同工伤的情况下，如果工伤认定部门作出了不予受理通知书，该通知书是会通知单位的。

详细解释：

1. 工伤认定流程：

   • 当员工发生工伤事故后，首先需要向当地的工伤认定部门（通常是人力资源和社会保障局）提出工伤认定申请。
   • 工伤认定部门在收到申请后，会进行审查，并根据审查结果作出是否受理的决定。

2. 不予受理通知书的送达：

   • 如果工伤认定部门认为申请不符合受理条件（如超过申请时效、证据不足等），会作出不予受理的决定，并出具不予受理通知书。
   • 根据相关法律法规和行政程序的要求，工伤认定部门在作出不予受理决定后，需要将该决定以书面形式通知申请人和相关单位（即员工所在单位）。

3. 单位的权利与义务：

   • 单位在收到不予受理通知书后，有权了解不予受理的具体原因，并可以根据实际情况决定是否采取进一步的法律措施（如申请行政复议或提起行政诉讼）。
   • 同时，单位也有义务将不予受理的情况告知员工，并协助员工处理后续事宜（如协商赔偿、申请劳动仲裁等）。

4. 法律后果与建议：

   • 如果单位对不予受理通知书有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自身的合法权益。
   • 对于员工而言，如果工伤认定部门不予受理其申请，也可以考虑通过其他途径（如与单位协商、申请劳动仲裁等）来寻求赔偿和救济。
   • 在此过程中，建议单位和员工都咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到充分保障。

额外提醒：

• 工伤认定和赔偿是一个复杂的法律过程，涉及多个环节和程序。因此，无论是单位还是员工，在处理相关事宜时都应保持谨慎和理性，避免因操作不当而损害自身权益。
• 如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和解决方案。