结论前置：遇到工厂通过人力资源公司用工却拖欠、扣工资的情况，你可以通过协商、投诉、申请劳动仲裁、提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。下面为你详细分析：
明确法律关系
在这种通过人力资源到工厂做事的模式下，存在两种可能的法律关系。一种是劳务派遣关系，即人力资源公司作为劳务派遣单位与你签订劳动合同，将你派遣到工厂工作，此时人力资源公司是用人单位，工厂是用工单位；另一种是劳务外包关系，人力资源公司承包了工厂的某项业务，你受人力资源公司雇佣为其完成该业务，这种情况下你与工厂一般没有直接的法律关系。不同的法律关系会影响维权的具体对象和方式。
维权途径
- 与工厂和人力资源公司协商
- 你可以先尝试与工厂的负责人以及人力资源公司的工作人员进行友好协商，明确指出他们拖欠和扣工资的行为违反了法律规定，要求他们立即支付被拖欠和扣除的工资。在协商过程中，要注意保留好相关的沟通记录，如聊天记录、通话录音等，以备后续使用。
- 例如，你可以整理好自己应得工资的计算明细，包括基本工资、加班工资、奖金等各项收入，向对方清晰地展示，增强协商的说服力。
- 向劳动监察部门投诉
- 如果协商无果，你可以向当地的劳动保障监察机构投诉。你需要准备相关的证据材料，如劳动合同（如果有）、工作证、考勤记录、工资条、与工资相关的沟通记录等，以证明你与用人单位或用工单位存在劳动关系以及对方拖欠、扣工资的事实。
- 劳动监察部门在收到投诉后，会进行调查核实。如果情况属实，他们会责令工厂和人力资源公司在规定的时间内支付你被拖欠和扣除的工资，并可能对他们进行相应的行政处罚。
- 申请劳动仲裁
- 若对劳动监察部门的处理结果不满意，或者你认为自己的权益受到了更严重的侵害，你可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。你需要提交仲裁申请书，详细说明你的仲裁请求（如要求支付拖欠的工资、经济补偿等）和事实理由，并附上相关的证据材料。
- 劳动仲裁委员会会依法受理你的申请，并安排开庭审理。在仲裁过程中，你要积极配合仲裁庭的工作，提供真实有效的证据，维护自己的合法权益。仲裁裁决具有法律效力，如果工厂和人力资源公司不履行裁决，你可以向人民法院申请强制执行。
- 提起诉讼
- 如果对劳动仲裁裁决不服，你可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，你需要按照法院的要求提交起诉状、证据材料等，并参加庭审活动。法院会根据双方提供的证据和法律规定进行审理，并作出判决。
- 例如，如果工厂和人力资源公司存在恶意拖欠工资等严重违法行为，法院可能会判决他们不仅要支付你被拖欠和扣除的工资，还要承担相应的赔偿责任。
注意事项
- 在整个维权过程中，要注意保留好所有的证据材料，这些证据将是你维护自己权益的重要依据。
- 要及时行使自己的权利，避免超过法定的时效期限。例如，申请劳动仲裁的时效期间为一年，从你知道或者应当知道自己的权益被侵害之日起计算。
- 如果你在维权过程中遇到困难或者不清楚具体的操作流程，可以随时向我咨询，我会为你提供详细的法律指导和帮助。