农村房屋签订的“永久性合同”，法院会根据合同性质、内容合法性及实际履行情况综合判定其效力，通常不会直接认定无效，但可能因违反法律强制性规定或公序良俗而部分无效或调整履行方式。具体分析如下：
1. 合同性质是关键：租赁、买卖还是其他？
- 若为租赁合同：根据《民法典》第705条，租赁期限不得超过20年；超过部分无效。即使合同写“永久性”，法院也会将20年后的部分视为无效，但20年内部分仍受保护。例如，双方约定“永久租赁房屋”，法院会认定前20年有效，后续需重新协商或终止。
- 若为买卖合同：农村房屋买卖需符合特定条件（如受让方为同一集体经济组织成员、房屋与宅基地使用权一并转让等）。若违反《土地管理法》中“宅基地使用权不得向城镇居民出售”的规定，合同可能被认定无效，房屋需返还，卖方退还购房款（但实践中可能考虑买方长期居住等情节，酌情补偿）。
- 若为其他合同：如合作建房、赠与等，需根据具体条款和法律关系判断效力。例如，合作建房合同若未明确产权分配，可能因约定不明引发纠纷。
2. 合同内容合法性是核心
- 违反法律强制性规定：如农村房屋买卖合同中，买方非本集体经济组织成员，或合同未报经集体经济组织批准，可能因违反《土地管理法》第62条（宅基地使用权转让限制）被认定无效。
- 违背公序良俗：若合同以“永久性”为名，实际意图是规避土地管理政策（如通过长期租赁变相买卖宅基地），法院可能以“损害社会公共利益”为由否定合同效力。
3. 实际履行情况影响裁判结果
- 已履行多年且无争议：若合同签订后双方已实际履行（如买方长期居住、卖方未提出异议），法院可能根据《民法典》第156条（民事法律行为部分无效不影响其他部分效力），认定合同有效部分继续履行，无效部分予以调整。例如，租赁合同超过20年部分无效，但买方已支付对价且房屋由其实际使用，法院可能判决卖方返还超出部分的租金或补偿买方损失。
- 未履行或引发纠纷：若合同未履行或一方反悔，法院会严格审查合同效力。例如，卖方以“合同无效”为由要求收回房屋，买方主张赔偿损失的，法院会结合双方过错程度（如卖方明知违法仍签订合同）分配责任。
4. 特殊情形：小产权房合同
- 农村“小产权房”（未取得合法产权证明的房屋）签订的“永久性合同”，因房屋本身违法，合同通常无效。但买方可能主张返还购房款及利息，卖方需承担缔约过失责任（如赔偿买方装修损失等）。
总结建议
- 签订合同前：明确合同性质（租赁/买卖/其他），确保内容符合法律（如租赁期限、买方资格），并报经集体经济组织批准（如涉及宅基地转让）。
- 发生纠纷时：收集合同、付款凭证、实际使用证据等，向法院主张权利。若合同部分无效，可要求调整履行方式或赔偿损失。
- 具体问题具体分析：农村房屋合同纠纷涉及土地管理、物权、合同等多部法律，建议根据实际情况向我详细描述，以便进一步分析。