判决书可以写明鉴定机构退回申请人费用的情况，但并非绝对，需视具体情形而定。以下从不同角度为你详细分析：
法律原则与依据
在民事诉讼中，判决书的撰写需遵循事实清楚、证据确凿、适用法律正确的原则。鉴定费用作为诉讼费用的一部分，其承担和退还情况若与案件事实认定、法律适用紧密相关，且对当事人权益有实质性影响，那么在判决书中予以明确是合理且必要的。这有助于保障当事人的知情权，确保判决的公正性和透明度。
具体情形分析
鉴定费用由过错方承担：
- 若因一方当事人的过错导致鉴定，且鉴定结果对案件处理有关键作用，那么鉴定费用通常由过错方承担。在此情况下，若鉴定机构已将费用退回申请人（如因鉴定未进行或鉴定结果未被采纳等原因），且该退回情况与案件处理有关联，判决书可以写明鉴定机构退回申请人费用的事实，以及该费用在当事人之间的最终分担情况。
鉴定费用由双方分担或按比例承担：
- 若鉴定费用需由双方分担或按比例承担，且鉴定机构已退回部分或全部费用给申请人，判决书同样可以写明退回情况，并明确退回费用在双方之间的分配比例或方式。这有助于避免后续因费用问题产生的纠纷。
鉴定费用与案件处理无直接关联：
- 若鉴定费用与案件处理无直接关联，或鉴定机构退回费用的情况对案件结果无实质性影响，那么判决书可能无需详细写明退回情况。但即便如此，若当事人提出相关请求或法院认为有必要说明，判决书仍可简要提及退回事实。
实际操作建议
- 当事人角度：若你作为当事人，在诉讼过程中关注鉴定费用的退还情况，可在庭审中明确提出相关请求，并提供鉴定机构出具的退费证明等证据材料。这有助于法院在撰写判决书时充分考虑你的诉求。
- 法院角度：法院在撰写判决书时，应全面审查案件事实和证据材料，包括鉴定费用的支付和退还情况。若该情况对案件处理有实质性影响，应在判决书中予以明确说明，以保障当事人的合法权益和判决的公正性。
总结来说，判决书是否写明鉴定机构退回申请人费用，需根据案件具体情况和法律规定综合判断。若你有相关法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。