结论：在现行法律体系下，“免于起诉”制度已被废除，我们主要依据“不起诉”制度来处理相关案件。以下是对“免于起诉”与“不起诉”的详细区别分析：
一、历史背景与制度变革
“免于起诉”制度：
- 在2012年《刑事诉讼法》修改之前，存在“免于起诉”制度。它是指检察机关对构成犯罪但依法不需要判处刑罚或可免除刑罚的被告人，决定不提起公诉的制度。
- 该制度因缺乏司法审判程序、可能侵犯被告人权利，已于1996年被《刑事诉讼法》逐步废除，并在2012年正式被“不起诉”制度所取代。
“不起诉”制度：
- 现行《刑事诉讼法》中的“不起诉”是检察机关的一项重要职权，也是刑事诉讼程序的关键环节。
- 它包括法定不起诉、酌定不起诉、证据不足不起诉以及附条件不起诉（针对未成年人），以更准确地反映法律精神和保障人权。
二、性质与适用条件
“免于起诉”（历史视角）：
- 性质：确认犯罪嫌疑人构成犯罪，但依法不需要判处刑罚或可以免除刑罚，决定不交付审判。它是对有罪人的一种终结诉讼决定。
- 适用条件：适用于犯罪嫌疑人行为构成犯罪，应负刑事责任，但依法不需判处刑罚或可免除刑罚的情况。
“不起诉”：
- 法定不起诉：犯罪嫌疑人无犯罪事实或符合《刑事诉讼法》规定的六种不追究刑事责任情形之一（如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的等）。
- 酌定不起诉：犯罪情节轻微，依法不需判处刑罚或可免除刑罚，如自首、立功、积极赔偿损失并取得谅解等。
- 证据不足不起诉：经补充侦查仍证据不足，不符合起诉条件。
- 附条件不起诉（针对未成年人）：在特定条件下，对涉嫌犯罪的未成年人暂时不予起诉，并设定一定的考验期。
三、法律后果
“免于起诉”（历史视角）：
- 犯罪嫌疑人行为被认定为犯罪，但因某些原因不进行刑事处罚，可能留有犯罪记录，对当事人的名誉和后续权益可能产生一定影响。
“不起诉”：
- 法定不起诉和证据不足不起诉：犯罪嫌疑人在法律上不被认定为有罪，无犯罪记录。
- 酌定不起诉：虽被认为构成犯罪，但因情节轻微等原因不起诉，对当事人名誉等影响相对较小，通常也不留犯罪记录。
- 附条件不起诉：在考验期内，如果未成年人遵守规定，表现良好，则不再起诉；否则，将依法提起公诉。
四、程序处理与救济途径
“免于起诉”（历史视角）：
- 原需经过审查和决定程序，由检察机关根据案件事实和法律规定作出决定。
- 救济途径相对有限，可能引发“未经审判即定罪”的争议。
“不起诉”：
- 由人民检察院根据案件具体情况，按法定程序审查决定。决定后公开宣布不起诉决定书，送达被不起诉人及其单位，被押者应立即释放。
- 被不起诉人如果不服决定，可以在规定时间内向人民检察院申诉；被害人如果对不起诉决定不服，也可以向上一级人民检察院申诉或直接向人民法院起诉。
五、实际案例说明
- “不起诉”案例：某企业涉嫌轻微污染环境罪，检察机关综合考量其自首、积极整改等因素，决定不起诉。该企业得以继续经营，且未留下犯罪记录。
- “免于起诉”历史遗留问题：上世纪80年代，部分案件因“免于起诉”导致当事人长期背负“有罪”标签，直至制度废除后才得以纠正。这体现了“免于起诉”制度可能带来的不公平后果。
总结与建议：在现代法律制度下，我们应准确使用“不起诉”表述，避免混淆“免于起诉”这一历史概念。在处理刑事案件时，检察机关应根据具体法律规定和案件情况，严格遵循不起诉制度的适用条件和程序要求。对于符合不起诉条件的案件，应依法作出不起诉决定，以保障当事人的合法权益和维护法律的权威性与公正性。如果您在房产纠纷、拆迁安置、合同纠纷、交通事故、公司事务、行政纠纷或经济纠纷等领域遇到法律问题，欢迎直接向我咨询。