关于您提出的“探亲假扣年终奖是否合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
首先，我们需要明确的是，探亲假是职工依法享受的假期之一。根据《国务院关于职工探亲待遇的规定》以及《工资支付暂行规定》的相关规定，职工在规定的探亲假期和路程假期内，用人单位应当按照劳动合同规定的标准支付劳动者工资。这意味着，在探亲假期间，职工的工资待遇是不应受到影响的，包括基本工资、津贴等劳动报酬。
接下来，我们针对年终奖这一具体问题进行探讨。年终奖是用人单位根据自身经营状况和职工的工作表现，在年底给予职工的一种奖励性薪酬。它并非职工的法定劳动报酬，而是用人单位的一种自主激励措施。然而，这并不意味着用人单位可以随意扣除或取消职工的年终奖。
在判断用人单位扣除年终奖是否合法时，我们需要考虑以下几个方面：
劳动合同或规章制度：首先，要查看劳动合同或用人单位的规章制度中是否有关于年终奖发放的具体规定。如果合同或制度中明确规定了年终奖的发放条件、标准以及扣除情形，那么用人单位在扣除年终奖时就需要遵循这些规定。
扣除的合理性：即使劳动合同或规章制度中有关于年终奖扣除的规定，用人单位也需要确保扣除的合理性。例如，如果职工因个人原因（如严重违反规章制度、给用人单位造成重大损失等）被扣除年终奖，那么这种扣除可能是合理的。但是，如果职工仅仅是因为休了探亲假就被扣除年终奖，那么这种扣除就可能缺乏合理性。
法律法规的遵循：最重要的是，用人单位在扣除年终奖时必须遵循相关法律法规的规定。根据《工资支付暂行规定》等法律法规，职工在依法享受假期（包括探亲假）期间，用人单位应按劳动合同规定的标准支付工资。因此，如果用人单位因为职工休了探亲假就扣除其年终奖，那么这种行为可能违反了相关法律法规的规定。
综上所述，如果用人单位仅仅因为职工休了探亲假就扣除其年终奖，那么这种行为很可能是不合法的。职工在遇到这种情况时，可以先与用人单位进行协商沟通，如果协商无果，可以向劳动争议仲裁机关申请仲裁或向人民法院提起诉讼来维护自己的合法权益。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。