若自己申请工伤但单位不配合，您可以通过以下途径维护自身权益：

1. 自行申报工伤认定
   根据《工伤保险条例》第十七条，职工发生事故伤害后，单位应在30日内申请工伤认定；若单位未申请，职工或其近亲属可在1年内直接向社保部门提出申请。此时需准备以下材料：
   

• 劳动关系证明（如劳动合同、工资流水、工牌等）；
  
• 医疗诊断证明（如病历、诊断书、检查报告等）；
  
• 事故证明（如证人证言、现场照片、报警记录等）。
  关键点：即使单位不配合，只要材料齐全，社保部门仍会受理并调查，您无需依赖单位。

1. 申请劳动仲裁确认劳动关系
   若单位否认劳动关系（如未签合同、未缴社保），需先通过劳动仲裁确认劳动关系。仲裁需提交：
   

• 工作证、考勤记录、工资转账记录等证明存在事实劳动关系的证据；
  
• 仲裁申请书（明确诉求为“确认劳动关系”）。
  流程：仲裁委受理后，通常45日内出裁决，若单位不履行可申请法院强制执行。

1. 向劳动监察部门投诉单位违法行为
   若单位存在未签合同、未缴社保、拒不配合工伤认定等违法行为，可向当地劳动监察大队投诉，要求：
   

• 责令单位补缴社保；
  
• 配合工伤认定程序；
  
• 处罚单位违法行为（如罚款）。
  优势：投诉处理周期较短，能快速推动单位履行义务。

1. 通过诉讼主张工伤待遇赔偿
   若单位仍拒绝赔偿，可向法院起诉，要求支付：
   

• 医疗费、停工留薪期工资、护理费等直接损失；
  
• 一次性伤残补助金、就业补助金等（需先完成工伤认定和劳动能力鉴定）。
  注意：诉讼需以工伤认定结论为依据，因此需优先完成前述步骤。

行动建议：

1. 立即收集证据（如医疗记录、工作证明、事故现场材料）；
   
2. 1年内向社保部门提交工伤认定申请；
   
3. 若单位否认劳动关系，同步申请劳动仲裁；
   
4. 过程中可向劳动监察部门投诉单位违法行为。
   

温馨提示：工伤认定是维权的核心，单位不配合不影响您自行申请。若对流程或材料有疑问，可直接向我咨询，我会为您详细解答。