若单位不配合申请工伤认定，劳动者可自行向社会保险行政部门提出申请，这是法律赋予劳动者的权利。具体分析如下：

1. 法律赋予劳动者自行申请工伤认定的权利
   根据《工伤保险条例》第十七条第二款规定，用人单位未在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起30日内提出工伤认定申请的，劳动者或其近亲属、工会组织可在1年内直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。因此，单位不配合不影响劳动者通过法定程序维护权益。

2. 劳动者需自行准备申请材料
   自行申请时需提交以下核心材料：

   • 工伤认定申请表（需载明事故时间、地点、原因及伤害程度）；
     
   • 劳动关系证明（如劳动合同、工资发放记录、工作证等）；
     
   • 医疗诊断证明（含医疗机构出具的初诊病历、诊断证明书或职业病诊断证明书）。
     若单位拒绝提供劳动关系证明，劳动者可通过劳动仲裁确认劳动关系（需提供工作证、考勤记录、工资转账记录等辅助证据）。

3. 单位不配合的法律后果

   • 行政责任：根据《工伤保险条例》第六十二条，用人单位未依法缴纳工伤保险费且未提交工伤认定申请，导致劳动者无法享受工伤保险待遇的，由用人单位承担全部赔偿责任。
     
   • 民事责任：若单位故意拖延或伪造材料阻碍认定，劳动者可依据《劳动合同法》第三十八条以“未依法为劳动者缴纳社会保险费”为由解除劳动合同，并主张经济补偿金。

4. 实务建议

   • 证据固定：及时保存事故现场照片、同事证言、报警记录等证据，证明伤害与工作相关；
     
   • 书面催告：通过EMS向单位发送《工伤认定申请催告函》，要求其在指定期限内配合，并留存寄送凭证；
     
   • 同步申请劳动仲裁：若单位否认劳动关系，可同步向劳动争议仲裁委员会申请确认劳动关系，缩短维权周期。

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