当遇到单位不配合申请工伤的情况时，您可以通过以下详细且具有深度的步骤来维护自己的合法权益：
一、明确申请时效，自行收集证据并提交工伤认定申请
了解申请时效：
- 根据规定，职工发生事故伤害或被诊断为职业病后，用人单位应在30日内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 若用人单位未在规定时限内提交申请，您或您的近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日或被诊断为职业病之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区的社会保险行政部门提出申请。
自行收集证据：
- 劳动关系证明：如劳动合同、工资支付记录（银行流水）、工作证、考勤记录等，这些都能有效证明您与单位之间的劳动关系。
- 工伤发生相关证据：包括事故现场的照片、视频、证人证言（如工友的目击证言）、医院诊断证明、病历等，这些材料能详细记录工伤发生的时间、地点、经过及伤害程度。
提交工伤认定申请：
- 填写《工伤认定申请表》，并附上上述收集的劳动关系证明材料和工伤发生相关证据。
- 部分地区支持线上提交申请，您可以咨询当地社保部门了解具体提交方式。
二、向劳动保障监察部门投诉
- 若单位不配合工伤认定，您可向当地的劳动保障监察部门投诉。
- 投诉时，详细说明单位的违法行为，如拒绝配合工伤认定、不提供必要证据等，并提供您已收集的相关证据材料。
- 劳动保障监察部门将依法对用人单位的违法行为进行监督检查，并有权责令其改正不配合工伤认定的行为。
三、等待工伤认定结果并配合调查
提出申请后：
- 社会保险行政部门受理申请后，将对提供的证据进行调查核实。
- 在此过程中，您应保持电话畅通，配合社会保险行政部门的调查，如实提供情况和证明材料。
等待认定结果：
- 社会保险行政部门将在受理申请之日起60日内作出工伤认定决定，并出具《认定工伤决定书》或《不予认定工伤决定书》。
- 对于事实清楚、权利义务明确的申请，社会保险行政部门将在15日内作出决定。
四、根据认定结果采取后续措施
认定为工伤：
- 您可凭工伤认定决定书享受工伤保险待遇，包括医疗费用、伤残津贴、一次性工伤医疗补助金等。
- 若单位未缴纳工伤保险，相关赔偿责任由单位承担。单位不履行赔偿义务时，您可通过劳动仲裁或诉讼维权。
不予认定工伤：
- 若您或您的近亲属、用人单位对认定决定不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
五、通过法律途径维护权益
劳动仲裁：
- 工伤认定完成后，若因单位不配合导致权益受损，您可向劳动争议仲裁委员会提起劳动仲裁，要求单位承担赔偿责任。
- 劳动仲裁审理期限一般为45日，特殊情况可延长至60日。在仲裁过程中，要积极配合仲裁庭的调查和询问，如实陈述事实，提供证据支持自己的主张。
提起诉讼：
- 对劳动仲裁结果不服的，您可向法院提起诉讼，通过司法途径维护自己的合法权益。
六、注意事项
- 保留证据：在整个过程中，您应妥善保留所有与工伤认定相关的证据材料，以备不时之需。
- 申请时效：务必在规定的1年时效期内提出工伤认定申请，逾期可能无法受理，从而影响您的权益维护。
综上所述，当单位不配合申请工伤时，您应明确申请时效，自行收集证据并提交申请，同时可向劳动保障监察部门投诉。在等待认定结果的过程中，应保持耐心并配合调查。若认定结果不如意或单位不履行赔偿义务，您可通过法律途径维护自己的合法权益。