工资由两家公司发放是否合法，这并非一个简单的是非问题，而是需要结合具体情况来分析。以下是我从不同角度为你进行的详细分析：

1. 关联关系下的合法发放：

   • 如果两家公司存在关联关系，比如母公司与子公司、总公司与分公司，或者它们之间有明确的合作协议，约定由其中一家公司代发另一家公司的工资，那么这种发放方式是合法的。在这种情况下，虽然工资是由两家公司发放，但实际上是基于它们之间的内部协议或合作关系，且员工的劳动关系通常只与其中一家公司建立。

2. 非关联关系下的可能违法情况：

   • 如果两家公司没有关联关系，也没有合作协议，却同时向同一员工发放工资，这可能涉及到一些法律问题。例如，这可能被视为逃避税收、社保等义务的行为，或者可能构成对员工劳动关系的混淆，导致员工在维权时面临困难。此外，如果这种发放方式没有得到员工的明确同意，还可能侵犯员工的知情权。

3. 具体情境下的合法性判断：

   • 在实际操作中，判断工资由两家公司发放是否合法，还需要考虑具体情境。比如，员工是否同时为两家公司提供劳动？两家公司是否都承认与员工的劳动关系？工资发放是否符合税收、社保等相关法律法规的规定？如果员工只是为其中一家公司提供劳动，而另一家公司只是代发工资，且这种代发行为得到了员工的同意和两家公司的明确约定，那么这种发放方式通常是合法的。

4. 法律建议：

   • 如果你作为员工，发现自己的工资由两家公司发放，且对此存在疑问或担忧，我建议你首先查看自己的劳动合同和工资条，了解工资发放的具体情况和依据。如果发现存在违法或不合规的情况，你可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
   • 如果你作为公司，需要考虑由两家公司发放工资的情况，我建议你确保这种发放方式符合相关法律法规的规定，且得到了员工的明确同意。同时，你还需要与另一家公司签订明确的合作协议，约定工资发放的具体方式和责任分担等事项。

总结来说，工资由两家公司发放是否合法，取决于两家公司之间的关系、员工的劳动关系以及工资发放的具体情况和依据。如果你对此存在疑问或担忧，建议你咨询专业的劳动法律师或劳动监察部门，以获取更准确的法律意见和帮助。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的解答，请直接向我咨询。