病假过了三个月是否可以辞退员工，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 医疗期内的保护：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，企业应根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
   • 在医疗期内，企业不得依据《劳动合同法》第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这意味着，如果员工的病假仍在医疗期内，企业不能仅因病假超过三个月就辞退员工。

2. 医疗期满后的处理：

   • 医疗期满后，如果员工仍不能从事原工作，也不能从事由企业另行安排的工作，企业可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。
   • 但在此之前，企业需要按照规定支付员工经济补偿，并可能需要支付医疗补助费。经济补偿的计算通常依据员工在企业的工作年限和月工资标准。
   • 计算公式示例：假设员工月工资为W元，工作年限为N年，则经济补偿金为N×W元（若N≥6个月，按整数年计算；若N<6个月，支付半个月工资作为经济补偿）。医疗补助费的具体标准可能因地区而异，需参照当地规定。

3. 特殊情况下的保护：

   • 如果员工患的是特殊疾病（如癌症、精神病、瘫痪等），在24个月内尚不能痊愈的，经企业和劳动主管部门批准，可以适当延长医疗期。
   • 在这种情况下，即使病假超过三个月，只要仍在延长的医疗期内，企业同样不能辞退员工。

4. 企业违法解除的后果：

   • 如果企业违反上述规定，在医疗期内或未按照法定程序辞退员工，员工有权要求企业继续履行劳动合同或者支付赔偿金。
   • 赔偿金的标准通常是经济补偿金的两倍。

建议：

• 对于企业而言，在处理病假员工的问题时，应严格遵守相关法律法规，确保程序的合法性和合规性。
• 对于员工而言，如果遭遇企业违法解除劳动合同的情况，应及时收集证据并寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

总结：病假过了三个月是否可以辞退员工，取决于员工的医疗期是否已满、是否能够从事原工作或另行安排的工作以及企业是否遵循了法定程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。