结论：高标准农田收费能否按标段收取及是否合理，需结合收费性质、政策依据、合同约定及公平原则综合判断，不能一概而论。 以下是具体分析：

1. 若收费属于“工程建设成本分摊”

若收费是针对高标准农田建设过程中，不同标段（如土地平整、灌溉排水、田间道路等工程）的实际投入成本，按标段分摊费用可能具有合理性。

• 法律依据：根据《农田建设项目管理办法》及地方实施细则，农田建设资金通常由中央财政、地方财政及社会资本共同承担，具体分摊比例需符合政策要求。若按标段收费是政策允许的细化操作（如某标段工程量大、成本高），且已通过审批或公示，则可能合法。
  
• 合理性关键：需确保分摊标准透明（如按工程量、面积或预算比例计算），且不重复收费（如已通过财政补贴覆盖的成本不得再向农户收取）。

2. 若收费属于“使用维护费用”

若收费是针对农田建成后的使用、维护（如灌溉用水费、设施维修费），按标段收取可能缺乏合理性。

• 法律依据：根据《农业法》《基本农田保护条例》，农田使用维护费用通常由受益主体（如农户、合作社）按实际使用量分摊，或由集体经济组织统一管理。若按标段收费，需证明不同标段的使用成本存在显著差异（如某标段灌溉设施损耗更大），且收费标准经民主议定程序（如村民会议表决）通过。
  
• 合理性风险：若无法证明成本差异或未履行民主程序，可能被认定为“乱收费”，侵犯农民权益。

3. 合同约定优先，但不得违反强制性规定

若收费依据是农户与建设方、村委会签订的合同（如土地流转合同、共建协议），需审查合同条款：

• 若合同明确约定按标段收费，且收费项目、标准符合政策及公平原则（如按投入比例分摊），则具有法律效力；
  
• 若合同条款显失公平（如某标段收费远高于实际成本）、或违反《民法典》中关于“格式条款无效”的规定（如未提示农户注意收费条款），农户可主张撤销或变更合同。

4. 实践中的常见争议点

• 标准模糊：部分地区政策对“标段”定义不清，导致收费随意性大；
  
• 程序缺失：未通过听证、公示等程序，农户对收费依据不知情；
  
• 用途不明：收费资金未专款专用，被挪作他用。
  建议：若遇到此类争议，可要求收费方提供政策依据、成本明细及民主议定记录，或向农业农村部门、市场监管部门投诉。

总结：高标准农田按标段收费的合理性需结合具体场景判断，核心是审查收费是否符合政策、是否公平透明、是否履行法定程序。若您遇到具体收费问题，可提供更多细节（如收费主体、项目名称、合同条款等），我将进一步为您分析。