国企员工违反保密规定，在年度考核中通常会面临不利后果，具体处理方式需结合违规情节严重程度、企业内部规章制度以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 企业内部处理机制

• 考核降级或扣分：国企年度考核一般包含德、能、勤、绩、廉等维度，保密合规是重要指标。若员工违反保密规定（如泄露商业秘密、未履行保密义务等），企业可依据内部考核制度直接降低其考核等级（如从“优秀”降为“合格”或“不合格”），或在考核评分中扣减相应分数，影响绩效奖金、晋升资格等。
• 岗位调整或解除合同：根据《劳动合同法》第39条，若员工严重违反企业规章制度（如保密制度），企业可单方解除劳动合同且无需支付经济补偿。例如，泄露核心机密导致企业重大损失的，可能直接触发解雇条款。

2. 法律责任与后果

• 民事赔偿：若员工行为构成侵权（如泄露商业秘密），企业可依据《反不正当竞争法》第17条要求其赔偿实际损失或侵权所得利益，甚至主张惩罚性赔偿。
• 行政处罚：若泄露国家秘密（如涉及国防、外交等敏感信息），可能违反《保守国家秘密法》，员工可能面临警告、罚款、拘留等行政处罚，企业也可能因管理失职被追责。
• 刑事责任：若情节严重（如故意泄露国家秘密罪、侵犯商业秘密罪），员工可能被追究刑事责任，面临有期徒刑、罚金等处罚。

3. 处理流程与合规建议

• 调查取证：企业应先通过内部调查固定证据（如聊天记录、文件流转记录等），确保处理程序合法。
• 制度依据：处理需以企业《保密制度》《员工手册》等文件为依据，且制度需经民主程序制定并公示，否则可能因“程序违法”被撤销。
• 员工申诉权：若员工对考核结果或处理决定不服，企业应告知其申诉渠道（如工会、劳动争议调解委员会），避免程序瑕疵引发纠纷。

4. 风险防范建议

• 对员工：严格遵守保密义务，签署保密协议；涉及敏感信息时，按流程审批并留痕；发现泄密风险及时上报。
• 对企业：完善保密制度，明确违规情形与处罚标准；定期开展保密培训；对核心岗位员工签订竞业限制协议并支付补偿。

若您或企业面临具体保密纠纷（如考核争议、泄密调查等），可进一步提供细节，我将结合《劳动合同法》《反不正当竞争法》等法规，为您制定应对方案。