在庭审时前期未发现对方证据有问题，再审时发现有重大问题，仍然是可以进行质证的。以下从几个方面为你详细分析：
一、再审程序中的质证权利
再审程序是对已经发生法律效力的判决、裁定、调解书，发现确有错误，依法再次进行审理的程序。在再审过程中，法院会重新审查案件事实和证据，因此，当事人有权对新的证据或者之前未充分质证的证据进行质证。这是保障当事人诉讼权利、确保案件公正审理的重要环节。
二、质证的具体操作
提出质证申请：在再审过程中，如果你发现对方提交的证据存在重大问题，如真实性存疑、合法性有问题或者与案件事实无关等，你可以向法院提出质证申请，要求对这份证据进行重新质证。
准备质证材料：在提出质证申请后，你需要准备相应的质证材料，如反驳证据、法律依据等，以支持你的质证观点。
参与质证过程：在法院安排的质证过程中，你需要积极参与，对对方提交的证据进行充分的质证，包括指出证据的问题、提出反驳意见等。
三、质证的法律效果
影响证据效力：通过质证，法院可以更加全面地了解证据的真实性和合法性，从而对证据的效力作出准确的判断。如果证据被认定存在问题，其效力可能会受到质疑，甚至被排除在定案依据之外。
影响案件结果：质证的结果直接关系到案件事实的认定和法律的适用，因此，它对案件的结果具有重要影响。如果通过质证发现了对方证据的重大问题，并成功地说服了法院，那么案件的结果可能会发生有利于你的变化。
四、注意事项
及时提出：在再审过程中，一旦发现对方证据存在问题，应及时向法院提出质证申请，以免错过质证时机。
充分准备：质证前应充分准备质证材料，确保能够有力地反驳对方证据，维护自己的合法权益。
遵守程序：在质证过程中，应遵守法院的程序规定，尊重法官和对方当事人的权利，确保质证过程的顺利进行。
如果你在再审过程中遇到了类似的问题，或者有任何其他法律疑问，都可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律意见和帮助。