行政诉讼中行政机关在二审阶段一般不能提交新证据，但在特定情况下可以提交。以下是对此问题的详细分析：

一、一般情况

根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，被告（即行政机关）应当在收到起诉状副本之日起十五日内向人民法院提交作出行政行为的证据和所依据的规范性文件。这意味着，在行政诉讼的一审阶段，行政机关应当完成证据的收集和提交工作。进入二审程序后，原则上不再接受新的证据，这是为了维护诉讼的稳定性和效率性，防止行政机关通过不断提交新证据来拖延诉讼进程。

二、特殊情况

尽管有上述一般原则，但也存在一些特殊情况，允许行政机关在二审中提交证据：

1. 原告或第三人提出新的事实、理由或证据：

   • 如果在一审程序中，原告或第三人提出了其在行政处理程序中没有提出的理由或者证据，且经人民法院准许，被告可以补充证据。同样地，如果原告或者第三人在第二审程序中提出了新的证据，二审法院也可能要求行政机关针对这些新证据进行答辩并提交相关证据材料。

2. 一审未收集的证据：

   • 根据《最高人民法院关于行政诉讼证据若干问题的规定》，如果被告在第一审程序中无正当理由未提供而在第二审程序中提供的证据，不能作为认定被诉具体行政行为合法的依据。但是，如果这些证据是在第一审程序中因客观原因无法收集的，且该证据对案件事实的认定有重大影响，二审法院可能会考虑采纳。不过，这种情况需要严格审查，确保行政机关不是故意拖延举证。例如，因自然灾害等不可抗力导致无法及时收集证据，或者证据涉及国家秘密、商业秘密等需要特殊程序才能获取的情况。

3. 其他法定情形：

   • 在某些特定情况下，如涉及国家利益、公共利益或他人合法权益的事实认定的，或者涉及依职权追加当事人、中止诉讼、终结诉讼、回避等程序性事项的，二审法院也可能要求行政机关提供相关证据。

三、提交新证据的程序要求

如果行政机关需要在二审中提交新证据，应当遵循以下程序要求：

• 证据的形式要求：提交的证据必须是原件或经核对无误的复印件、复制件，以确保其真实性。
• 证据链的完整性：应提供完整的证据链，以证明证据的真实性和关联性，增强其在法庭上的说服力。
• 遵守法庭规则和程序：行政机关应按照法院的要求进行举证和质证，遵守法庭规则和程序，确保诉讼的有序进行。例如，在二审开庭前或开庭审理时提出新证据；若二审不开庭审理，则需在法院指定期限内提出。逾期提供证据需说明理由，否则视为放弃举证权利。提交方式通常为书面形式，并附证据清单及副本，以便法院向对方送达。

四、法院对新证据的审查与采纳

二审法院在收到行政机关提交的新证据后，会进行严格的审查。审查的重点包括证据是否符合法定形式、是否与案件事实相关以及是否满足新证据的定义和范畴。如果证据符合这些要求，法院会予以采纳；如果不符合，法院可以不予采纳。同时，法院还会评估行政机关为何未在一审中提交该证据的理由。若理由合理（如客观原因无法取得），即使为新证据，也可能被采纳。

总结与建议：

行政诉讼中行政机关在二审阶段提交新证据需严格遵循法律规定和程序要求。在一般情况下，行政机关应在一审阶段完成证据的收集和提交工作。但在特定情况下，如原告或第三人提出新的事实、理由或证据，或一审因客观原因未收集到关键证据等，行政机关可以在二审中提交新证据。然而，这并不意味着行政机关可以随意拖延举证或滥用新证据提交权。因此，建议行政机关在行政诉讼中应尽早收集和提交证据，确保诉讼的顺利进行和自身权益的维护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。