破产重整程序中工抵房的处理需结合企业重整计划、债权人会议决议及物权变动规则综合判断，核心结论如下：

1. 工抵房的权属确认是处理前提
   需核查工抵房是否已完成物权变动：

   • 若已办理产权过户登记，房屋所有权已转移至债权人名下，原则上不属于破产财产，管理人无权处置；
     
   • 若仅签订以房抵债协议但未过户，根据《民法典》第209条，房屋所有权未转移，仍属于债务人财产，需纳入破产重整程序统一处置。
     实务提示：重点审查抵债协议签订时间、房屋交付情况及是否存在恶意串通损害其他债权人利益的情形。

2. 破产重整计划中的处理方案
   根据《企业破产法》第81条，重整计划需明确债务人财产的处置方式：

   • 继续履行抵债协议：若重整计划认可工抵房的效力，管理人可协助办理过户手续，但需优先保障职工债权、税收债权等优先权；
     
   • 撤销抵债协议：若抵债行为发生在破产申请受理前6个月内且存在低价转让等情形，管理人可根据《企业破产法》第31条行使撤销权，房屋需重新纳入破产财产分配；
     
   • 折价变现：若重整计划选择出售工抵房，需通过债权人会议表决，并按照法定清偿顺序分配价款（优先权→普通债权→股东权益）。

3. 债权人权益保护路径

   • 优先权人：建设工程价款优先受偿权人（承包人）可依据《民法典》第807条主张对工抵房的优先权，但需在法定期限内行使；
     
   • 普通债权人：若工抵房被撤销或变现，普通债权人可按重整计划确定的清偿比例受偿；
     
   • 异议权：债权人对工抵房处理方案有异议的，可在债权人会议表决时提出，或依据《企业破产法》第66条向法院申请复议。

4. 税务合规风险
   工抵房涉及增值税、土地增值税、契税等税负，需注意：

   • 债务人以房抵债视同销售，需按市场价计算增值税；
     
   • 债权人取得房屋需缴纳契税，但部分地区对破产企业资产处置有税收优惠；
     
   • 管理人应协调税务机关明确税负承担主体，避免因税务问题导致过户障碍。

实务建议：若您是债权人或管理人，建议立即核查工抵房的权属状态、抵债协议效力及重整计划内容，必要时可委托律师对协议效力、优先权行使期限等关键问题出具法律意见，以最大限度维护权益。如有具体案例或合同文本，可进一步向我提供细节以便针对性分析。