针对安全员擅离职守的处理，需结合具体情况从法律、公司制度及实际后果等多角度分析，具体如下：

一、法律层面：是否构成违法或犯罪需看具体后果

1. 若擅离职守未造成严重后果
   根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位可解除劳动合同。若公司制度明确规定“安全员不得擅离职守”，且该制度经民主程序制定并公示，则公司可依据制度解除劳动合同，无需支付经济补偿。
   示例：某建筑公司安全员在施工期间擅自离开岗位2小时，虽未发生事故，但公司依据内部制度以“严重失职”为由解除合同，法院可能支持公司决定。

2. 若擅离职守导致严重后果
   若因擅离职守引发安全事故（如人员伤亡、财产损失），可能涉及刑事责任。根据《刑法》第一百三十四条【重大责任事故罪】，在生产、作业中违反安全管理规定，因而发生重大伤亡事故或造成其他严重后果的，处三年以下有期徒刑或拘役；情节特别恶劣的，处三年以上七年以下有期徒刑。
   示例：某化工厂安全员擅离职守期间发生爆炸，造成3人死亡，该安全员可能因“重大责任事故罪”被追究刑事责任。

二、公司制度层面：需明确制度依据及程序合法性

1. 制度依据
   公司需在劳动合同、员工手册或安全管理制度中明确规定“安全员职责”及“擅离职守的处罚措施”。若制度未明确，公司单方解除合同可能被认定为违法解除，需支付赔偿金（2N，N为工作年限）。
   关键点：制度需经职工代表大会或全体职工讨论协商确定，并公示或告知员工，否则可能无效。

2. 程序合法性
   即使制度合法，公司解除合同也需履行法定程序：

   • 调查事实（如调取监控、证人证言）；
     
   • 通知工会（如有）；
     
   • 向员工送达书面解除通知，说明理由及依据；
     
   • 出具离职证明并办理档案、社保转移手续。
     示例：某公司未调查即以“擅离职守”为由解除合同，员工申请仲裁后，公司因程序违法被判支付赔偿金。

三、实际后果层面：需评估损失及责任划分

1. 经济损失赔偿
   若擅离职守导致公司损失（如设备损坏、工期延误），公司可依据《工资支付暂行规定》第十六条，要求员工赔偿部分损失（一般不超过月工资的20%）。
   公式：赔偿金额 = 实际损失 × 员工过错比例（通常≤20%）。
   示例：安全员擅离职守导致设备损坏，损失10万元，法院可能判员工赔偿2万元（20%）。

2. 第三方责任
   若事故涉及第三方（如施工方、供应商），公司可能需承担连带责任，但可向擅离职守的安全员追偿。
   示例：安全员擅离职守导致工人受伤，公司赔偿后，可依据内部责任认定向安全员追偿部分款项。

四、建议行动步骤

1. 公司角度

   • 立即调查事实，固定证据（如监控、签到记录）；
     
   • 核对制度合法性及程序合规性；
     
   • 根据后果严重程度决定处罚方式（警告、降薪、解除合同）；
     
   • 涉及刑事责任时，及时报警并配合调查。

2. 员工角度

   • 若认为处罚过重，可申请劳动仲裁，主张公司违法解除或赔偿计算错误；
     
   • 若涉及刑事责任，尽快委托律师介入，争取从轻情节（如自首、立功）。

如有进一步疑问（如制度制定、赔偿计算或刑事辩护），可直接向我咨询，我会结合具体案情提供详细方案。