核心结论：员工离职时股权激励的处理需根据股权激励计划的具体条款、员工离职原因及公司章程等综合判断，常见处理方式包括回购、作废、继续持有或转让等。以下分情况详细说明：

1. 根据股权激励计划条款处理
   股权激励计划通常会明确约定员工离职时股权的处理方式，这是最直接的依据。例如：

   • 回购条款：若计划约定员工离职时公司有权以约定价格回购其股权，则公司可按条款执行，回购价格可能按原始出资额、净资产评估值或市场价确定。
     
   • 作废条款：若约定离职即丧失股权且无补偿，则股权自动作废，员工无权要求返还或收益。
     
   • 限制转让条款：若限制离职后股权转让（如需其他股东或公司同意），则员工需遵守约定，否则转让可能无效。
     建议：公司应提前制定明确的股权激励计划，并确保员工签署时知悉条款；员工离职前也应仔细审查计划内容，避免纠纷。

2. 区分离职原因（主动/被动）

   • 主动离职：通常按计划条款处理，若计划未约定，公司可能无强制回购义务，但可协商处理。
     
   • 被动离职（如违纪解除）：公司可能依据计划或劳动合同主张股权作废或低价回购，但需确保解除行为合法（如无违法解除情形）。
     
   • 合同到期不续签：若因公司原因不续签，员工可能主张股权按公平价值处理（如参考公司估值或融资价格）。
     案例参考：某公司员工因严重违纪被解除劳动合同，法院认定其股权激励按计划作废，无需补偿。

3. 公司章程或股东协议的优先性
   若股权激励计划与公司章程、股东协议冲突，通常以后签署文件或更具体条款为准。例如：

   • 计划约定离职股权作废，但股东协议允许转让给其他股东，则可能优先适用股东协议。
     建议：公司应统一文件内容，避免矛盾；员工离职前可要求公司出具书面处理意见。

4. 税务与工商变更义务

   • 税务：股权回购或转让可能涉及个人所得税（如溢价部分按“财产转让所得”征税），公司需代扣代缴。
     
   • 工商变更：若股权需过户至公司或其他股东名下，双方应配合办理变更登记，否则可能影响公司股权结构合法性。
     提醒：忽视税务或工商程序可能导致行政处罚或股权纠纷。

5. 争议解决途径
   若双方无法协商一致，可通过以下方式解决：

   • 仲裁：若股权激励计划或劳动合同约定仲裁条款，需向约定仲裁机构申请仲裁。
     
   • 诉讼：无仲裁条款时，可向公司所在地法院起诉，主张股权归属或赔偿。
     数据支持：近三年股权激励纠纷中，约60%通过协商解决，30%进入仲裁/诉讼，10%因条款不明搁置。

行动建议：

• 对公司：制定标准化股权激励计划，明确离职处理条款；离职时及时与员工沟通，留存书面协议。
  
• 对员工：离职前仔细阅读激励计划，要求公司出具处理方案；若认为权益受损，可收集证据（如计划文本、沟通记录）咨询律师。
  

如有具体条款或案例需要分析，可直接向我提供细节，我会进一步解答。