员工休息日是否有工资，需根据休息日的性质以及劳动合同或公司规章制度的具体规定来判断。以下从不同角度进行分析：
法定休息日（如周末）：
- 一般情况：在大多数情况下，法定休息日（如周六、周日）员工是不工作的，因此通常不涉及工资支付问题。但如果员工在法定休息日被安排加班，根据《劳动法》的相关规定，公司应当支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
- 特殊工时制度：如果员工实行的是不定时工作制或综合计算工时工作制，且经劳动行政部门批准，那么休息日的安排可能更加灵活。在这种情况下，工资支付需依据劳动合同或公司规章制度的具体规定，以及实际的工作情况来确定。
带薪年休假等法定假期：
- 带薪年休假：根据《职工带薪年休假条例》，员工在带薪年休假期间，享受与正常工作期间相同的工资收入。这意味着，员工在带薪年休假期间是有工资的。
- 其他法定假期：如婚假、产假、丧假等，员工在这些假期期间也通常享有工资待遇，具体依据相关法律法规和公司规章制度执行。
公司规章制度或劳动合同中的特别规定：
- 有些公司可能会在规章制度或劳动合同中规定，员工在特定休息日（如公司规定的额外休息日）享有工资待遇。这种情况下，员工在这些休息日是有工资的。
- 反之，如果公司规章制度或劳动合同中明确规定，某些休息日员工不享有工资待遇，且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么员工在这些休息日可能就没有工资。
建议：
- 对于员工而言，如果对自己的工资待遇有疑问，首先应当查阅自己的劳动合同和公司规章制度，了解其中关于休息日工资支付的具体规定。
- 如果发现公司存在未按照规定支付工资的情况，可以与公司进行协商，要求公司补发工资。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果公司未按照法律法规或劳动合同的规定支付员工休息日的工资，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付工资、加付赔偿金等。
- 员工也可能因此与公司产生劳动争议，影响双方的劳动关系和员工的职业声誉。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。