申请停工留薪期工资的核心流程是：先确认停工留薪期时长，再向用人单位提交书面申请及相关证明材料，若协商不成可通过劳动仲裁维权。以下是具体说明：

一、确认停工留薪期时长

根据《工伤保险条例》第三十三条，停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或情况特殊可经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认适当延长，但延长不得超过12个月。
具体操作：

1. 凭医院出具的《疾病诊断证明书》《病假建议书》等材料，向用人单位提出停工留薪期申请；
   
2. 若用人单位对时长有异议，可共同委托设区的市级劳动能力鉴定委员会确认；
   
3. 鉴定结论出具前，用人单位应按原工资福利待遇按月支付工资。

二、提交书面申请及证明材料

需准备的材料：

1. 工伤认定决定书（证明属于工伤范畴）；
   
2. 医院出具的病假证明、诊断证明、病历等（证明需停工治疗）；
   
3. 工资发放记录（如银行流水、工资条，用于核对原工资标准）；
   
4. 书面申请书（明确申请停工留薪期工资的起止时间、金额等）。
   

提交方式：
直接向用人单位的人力资源部门或负责人提交，建议通过EMS邮寄（留存寄送凭证）或当面提交并签字确认，避免口头申请无证据。

三、用人单位拒绝支付的处理

若用人单位以“未认定工伤”“停工留薪期过长”等理由拒绝支付，可按以下步骤维权：

1. 协商：先与用人单位沟通，明确法律依据（如《工伤保险条例》第三十三条），要求按原工资标准支付；
   
2. 投诉：向当地劳动监察大队投诉（可通过12333热线或官网举报），劳动监察部门会介入调查并责令整改；
   
3. 仲裁：若投诉无果，可在1年内向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张停工留薪期工资及可能的赔偿金。
   

提示：停工留薪期工资按“原工资福利待遇”计算，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴等，但不含加班费。若用人单位未按标准支付，仲裁时可要求补足差额。

如有其他细节问题（如如何计算原工资、异地工伤如何处理等），可直接向我咨询，我会结合具体案例为您详细解答。