作为个体户，当您的员工怀孕时，您需要遵循《女职工劳动保护特别规定》来确保员工的权益得到充分保护。以下是一些具体的处理建议：

一、孕期保护

1. 劳动调整：如果怀孕员工在孕期不能适应原劳动，您应根据医疗机构的证明，适当减轻其劳动量或者安排其他能够适应的劳动。特别是对于怀孕7个月以上的女职工，不得延长其劳动时间或者安排夜班劳动，并应在劳动时间内安排一定的休息时间。

2. 产前检查：怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间应计入劳动时间，不应因此扣减工资或视为缺勤。

二、产假安排

1. 产假天数：女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天。如果难产，增加产假15天；生育多胞胎的，每多生育1个婴儿，增加产假15天。对于怀孕未满4个月流产的，享受15天产假；怀孕满4个月流产的，享受42天产假。

2. 产假工资：产假期间，如果员工已经参加生育保险，生育津贴将按照用人单位上年度职工月平均工资的标准由生育保险基金支付。如果未参加生育保险，则按照女职工产假前工资的标准由用人单位支付。

三、哺乳保护

1. 哺乳时间：对于哺乳未满1周岁婴儿的女职工，您不得延长其劳动时间或者安排夜班劳动。同时，应在每天的劳动时间内为哺乳期女职工安排1小时哺乳时间。如果女职工生育多胞胎，每多哺乳1个婴儿，每天应增加1小时哺乳时间。

四、禁止歧视与解雇

1. 禁止歧视：您不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或与其解除劳动或聘用合同。这是保护女职工权益的重要法律原则。

五、其他注意事项

1. 禁忌劳动：确保怀孕员工不从事女职工禁忌从事的劳动范围，如矿山井下作业、高强度体力劳动等。您应将本单位属于女职工禁忌从事的劳动范围的岗位书面告知女职工。

2. 设施改善：如果条件允许，您可以根据女职工的需要，建立女职工卫生室、孕妇休息室、哺乳室等设施，以妥善解决女职工在生理卫生、哺乳方面的困难。

3. 法律监督：县级以上人民政府人力资源社会保障行政部门、安全生产监督管理部门将按照各自职责负责对用人单位遵守本规定的情况进行监督检查。您应积极配合相关部门的检查，确保合规经营。

总之，作为个体户，您应充分了解并遵守《女职工劳动保护特别规定》，确保怀孕员工的权益得到充分保护。这不仅有助于维护良好的劳动关系，也有助于提升企业的社会形象和声誉。